| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,748,561 | T→C | intergenic (+28603/‑46281) | unknown → / → unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Leu‑CAA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,748,561 | 0 | T | C | 100.0% | 221.1 / NA | 79 | intergenic (+28603/‑46281) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Leu‑CAA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/43); total (36/43) | |||||||||||
GTAAAATATCGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTTTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTGGGGCATTCTATGGGCGGCAAAACCGCCATGGTA > 1/1748327‑1748797 | gTAAAATATCGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACgg > 1:873583/1‑251 (MQ=255) tAAAATATCGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGt < 1:467449/251‑1 (MQ=255) atatCGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACACAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTAt > 1:185104/1‑251 (MQ=255) tatCGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTAtt < 1:250395/251‑1 (MQ=255) cGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCgg < 1:12362/251‑1 (MQ=255) cACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGatat < 1:632209/251‑1 (MQ=255) ttCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGaat > 1:841753/1‑251 (MQ=255) ccAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAtt > 1:431206/1‑251 (MQ=255) ccAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAtt < 1:40773/251‑1 (MQ=255) cAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAttt < 1:831042/251‑1 (MQ=255) gATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTAt > 1:202761/1‑216 (MQ=255) gtTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGc > 1:311520/1‑250 (MQ=255) gCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGaat < 1:490574/226‑1 (MQ=255) tatTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTg < 1:50006/251‑1 (MQ=255) ttGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGaa > 1:779668/1‑251 (MQ=255) aTAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGAt < 1:559616/251‑1 (MQ=255) aGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTg > 1:838281/1‑242 (MQ=255) gTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTa < 1:272999/184‑1 (MQ=255) cTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAttt < 1:561919/203‑1 (MQ=255) cTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGt > 1:237209/1‑251 (MQ=255) aTAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGAtt < 1:731568/251‑1 (MQ=255) tttcattttcTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTgcgc < 1:80514/251‑1 (MQ=255) tctctctcCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGAt > 1:548722/1‑216 (MQ=255) ctctcCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGcc > 1:677857/1‑219 (MQ=255) ctcCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGcc < 1:487925/193‑1 (MQ=255) ctcCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGa > 1:652084/1‑207 (MQ=255) ccACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTgg > 1:243444/1‑141 (MQ=255) tgcttgATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAttt < 1:825211/173‑1 (MQ=255) tgcttgATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGtattat > 1:773046/1‑182 (MQ=255) cttgATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTcac < 1:24057/250‑1 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTTCTCAAATTTCAATTTAATGAATGAAAACAAGCAATGAACAAGCCGACTCTGGTTTTTGTTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCAttt < 1:321995/204‑1 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAGATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTgaagaa > 1:738119/1‑251 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTAtt > 1:130885/1‑145 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGc < 1:33195/149‑1 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAtt < 1:816519/162‑1 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAg < 1:682335/244‑1 (MQ=255) aTTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTgaagaa > 1:260852/1‑251 (MQ=255) tttAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGaaa < 1:74083/251‑1 (MQ=255) tttAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGaaa < 1:594372/251‑1 (MQ=255) cTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTg > 1:26016/1‑182 (MQ=255) cTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGaa > 1:402029/1‑249 (MQ=255) cTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGaa > 1:633788/1‑249 (MQ=255) gCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAAATTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGa > 1:757574/1‑242 (MQ=255) caTTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGa > 1:614885/1‑251 (MQ=255) aTTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGt > 1:453275/1‑150 (MQ=255) aTTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGAtt > 1:753279/1‑247 (MQ=255) ttATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGAt > 1:194227/1‑176 (MQ=255) aGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGa > 1:637946/1‑251 (MQ=255) aTTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGa < 1:72295/247‑1 (MQ=255) aataaATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAAttt > 1:156414/1‑130 (MQ=255) aataaATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGa > 1:273744/1‑241 (MQ=255) aataaATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGttt > 1:80032/1‑251 (MQ=255) tctcTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGAtt < 1:593637/176‑1 (MQ=255) ctAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTc < 1:520756/251‑1 (MQ=255) gCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGAtgtg < 1:538788/235‑1 (MQ=255) gCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAAt > 1:622759/1‑251 (MQ=255) aTTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATc < 1:306788/251‑1 (MQ=255) aTTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATc < 1:337576/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAGAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:300335/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:158066/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:211278/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:337630/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:345490/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:805704/251‑1 (MQ=255) ttACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:274580/251‑1 (MQ=255) aTGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGa > 1:352051/1‑251 (MQ=255) aCTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTtgg < 1:619279/251‑1 (MQ=255) aaTTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGAtt < 1:436834/138‑1 (MQ=255) aaTTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGaaa < 1:802763/174‑1 (MQ=255) aaTTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTgggt > 1:311954/1‑250 (MQ=255) tttCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTgggtca > 1:778716/1‑248 (MQ=255) aTTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTgcgc > 1:334217/1‑136 (MQ=255) aTTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTGGGTCATTCTa < 1:545642/251‑1 (MQ=255) aaTGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGAGTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTGGGTCATTCTATggg < 1:194134/251‑1 (MQ=255) gAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGtt > 1:23745/1‑36 (MQ=255) gAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:357563/214‑1 (MQ=255) ttAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCAc < 1:810556/198‑1 (MQ=255) tAACAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAg < 1:641960/135‑1 (MQ=255) aaCAAGCCGACTCTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTGGGTCATTCTATGGGCGGCAAAACCGCCATGGTa > 1:40430/1‑249 (MQ=255) | GTAAAATATCGGATGCACTTTCGCCAATAGATTGCGTGTTACCGGCAATATATTGATAAAGTTCTTCGTCCACTTCGATAATTTTCATTTTCTCTCTCCACTTGCTTGATCTATTTAATCTTTTGGCACATTATAGCGAGCTATTAATAAATTCTCTAGCCAAAAATTTACCCGATGCAAAAATTACTCAAATTTCAATTTAATGAATTAAAACAAGCAATTAACAAGCCGACTTTGGTTTTTATTCACGGTTTATTCGGCGATATGAATAATTTGGGTATTATTGCCCGCGCATTTAGTGAAGATTATGCCATTTTACGGGTAGATTTGCGCAATCACGGCGCGAGCTTTCACAGTGAAGAAATGAACTATGATTTGATGGCGGAAGATGTGTTTCATGTCATTCAATCCTTATCACTGCGCGAAGTGATTTTGGTGGGGCATTCTATGGGCGGCAAAACCGCCATGGTA > 1/1748327‑1748797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |