| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,713,934 | T→G | intergenic (‑43986/‑5949) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Arg‑CCG/tRNA‑Asn‑GTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,713,934 | 0 | T | G | 100.0% | 134.0 / NA | 48 | intergenic (‑43986/‑5949) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑CCG/tRNA‑Asn‑GTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (24/24); total (24/24) | |||||||||||
TTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACAACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTAC‑GGAAC‑AAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATACCACGCCGTTGCGTGATACTTCTCACAAAAACGGAA‑GTTTTTATTTGCCAAAGGAAATCGCATAGTCATATGCTCTCTTCCGTTTAATAAAAAATCTTATG‑GAATCAAAAATAAATTAAAGGAGTTCGTATGAGTGTTTTAAGTTATGCCCAAAAAATCGGGCAAGCCTTAATGGTACCCGTTGCCGTTTTGCCGGCAGCCGCCGTATTAATGGGGATCGGCTATTGGCTTGACCCGGACGGCTGGGGCGCAAACAGCCAACTTGCCGCCTTATTAATCAAGTCCGGCGCGGCAATCATCG > 1/1713696‑1714169 | ttAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTAC‑GGAAC‑AAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATACCACGCCGTTGCGTGATACTTCTCACAAAAACGGAA‑GTTTTTATTTGCCAAAGGAAATCGCATAGGCATATGctctct < 1:109466/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |