| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,713,636 | A→G | intergenic (‑43688/‑6247) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Arg‑CCG/tRNA‑Asn‑GTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,713,636 | 0 | A | G | 100.0% | 191.2 / NA | 68 | intergenic (‑43688/‑6247) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑CCG/tRNA‑Asn‑GTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (38/30); total (38/30) | |||||||||||
ACCTGATCTGCCGGCACCAAAAGGGCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTACGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACAACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATACCACGC > 1/1713389‑1713874 | aCCTGATCTGCCGGCACCAAAAGGGCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCgg < 1:724123/251‑1 (MQ=255) gATCTGCCGGCACCAAAAGGGCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGgtgt > 1:31038/1‑250 (MQ=255) gCCGGCACCAAAAGGGCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTaca > 1:124542/1‑251 (MQ=255) ccGGCACCAAAAGGGCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTacaa < 1:671173/251‑1 (MQ=255) gggCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAg < 1:757029/247‑1 (MQ=255) gCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAAt > 1:700821/1‑250 (MQ=255) ccAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATc < 1:553385/250‑1 (MQ=255) cGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGgtggtg > 1:390000/1‑251 (MQ=255) gTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCACATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCAGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGaa > 1:438357/1‑251 (MQ=255) gTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGaa > 1:833527/1‑251 (MQ=255) gTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGaa > 1:826331/1‑251 (MQ=255) gTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGCCTATGGTGTTGCGGTGTCTTacaa > 1:541437/1‑223 (MQ=255) tttAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGaaa < 1:694621/251‑1 (MQ=255) gTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAAcgg > 1:488412/1‑250 (MQ=255) gggCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGc > 1:899303/1‑249 (MQ=255) cTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTaa > 1:760156/1‑251 (MQ=255) ggCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACaa > 1:888886/1‑251 (MQ=255) ggCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACaa > 1:41998/1‑251 (MQ=255) cATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACt < 1:337299/240‑1 (MQ=255) gcgcAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCaaa > 1:634410/1‑251 (MQ=255) cTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTaa > 1:811226/1‑251 (MQ=255) cTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAATGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGc > 1:438298/1‑226 (MQ=255) ccGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGc < 1:144056/221‑1 (MQ=255) ccGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAAt > 1:176206/1‑249 (MQ=255) ccGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATaa > 1:710336/1‑251 (MQ=255) aaaCAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCt < 1:892776/217‑1 (MQ=255) aaTTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCaaa > 1:661654/1‑251 (MQ=255) aTTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTc < 1:725286/195‑1 (MQ=255) aTTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGc < 1:737312/211‑1 (MQ=255) aaaGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTacaac < 1:250054/138‑1 (MQ=255) ggCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTaaaaaa > 1:196792/1‑251 (MQ=255) aTGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGa < 1:651962/251‑1 (MQ=255) cccACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGc < 1:108390/251‑1 (MQ=255) aaGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGa < 1:601195/251‑1 (MQ=255) ggCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTAcgac > 1:56901/1‑183 (MQ=255) gCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACg < 1:891321/250‑1 (MQ=255) aaGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTaa > 1:283336/1‑251 (MQ=255) aaGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTaa > 1:882232/1‑251 (MQ=255) aaGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTaa > 1:357351/1‑251 (MQ=255) aaGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGAAGGCAAAAAAATAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTaa > 1:340846/1‑251 (MQ=255) aGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGa > 1:891820/1‑243 (MQ=255) tGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTg < 1:859850/251‑1 (MQ=255) ggCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGt > 1:689489/1‑251 (MQ=255) gACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAgg < 1:229851/212‑1 (MQ=255) ccTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑aaa > 1:295454/1‑251 (MQ=255) caacGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTaaaa > 1:460827/1‑187 (MQ=255) caacGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACgg < 1:154378/251‑1 (MQ=255) cGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AAc < 1:317904/251‑1 (MQ=255) ttATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGt < 1:172966/61‑1 (MQ=255) ttATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATtg < 1:237675/214‑1 (MQ=255) tCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGGACAAAATTTAGGA‑AAAAAGGGACCCGTTTTaa > 1:526309/1‑251 (MQ=255) cGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTaaaa < 1:55181/251‑1 (MQ=255) gTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTAc > 1:92511/1‑105 (MQ=255) aTTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTAAAATAAGcc < 1:298658/251‑1 (MQ=255) ggTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATc < 1:408654/51‑1 (MQ=255) ggTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAAATTAATG‑AAAAAAGGGACCGTTTTTAAAAAAACCACCGCCAATa > 1:406347/1‑251 (MQ=255) gTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATtg < 1:609764/193‑1 (MQ=255) gTATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGGAC‑AAAATTAAGGAAAAAAGGGAACGTTTTTaaaaaaaacaccccccaaaa > 1:406660/1‑235 (MQ=255) tATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATAc < 1:488626/250‑1 (MQ=255) tATCGGCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATAc < 1:218071/250‑1 (MQ=255) ggCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTaaacgtcattggcgt > 1:16116/1‑156 (MQ=255) ggCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGGAC‑AAAATTATGG‑AAAAAAGGAACCGTTTTAAAATaaaacacccccaaaaccacc > 1:77662/1‑232 (MQ=255) ggCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAAATTACGG‑AACAAGGGAACCGGTTTTAAATaaaacacccccaaaaacaca > 1:528068/1‑232 (MQ=255) gCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATc > 1:750029/1‑44 (MQ=255) gCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATtg < 1:142019/187‑1 (MQ=255) gCTATGGTGTTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAAATTACGG‑AACAAAGGGACCGTTTTTAAATAAAACACCCCCAATACCACGc > 1:817787/1‑250 (MQ=255) gtgtTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTg < 1:57089/175‑1 (MQ=255) gtgtTGCGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACGACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATAcc < 1:390169/240‑1 (MQ=255) | ACCTGATCTGCCGGCACCAAAAGGGCAAAGCCAAGACGGTTTAGCGGGTGCCATGGCGGGCTATAGCCACGGGCATTATTTAGTCACCGGTGGCGCAAACTTCCCGGGCTCCGTAAAACAATTCAAAGAAGGCATGCTTCACGCCCACAAAGGCTTAAGCAAGGCCTGGCACAAAGACATTTACACCTTAAACAACGGTAAATGGCAAATTATCGGTGAATTGCCTGCCGGTATCGGCTATGGTGTTACGGTGTCTTACAACAATCAAGTGCTTTTAATCGGTGGTGAAACCAACGGCGGCAAAGCCTTAACTTCCGTACAAAGCATGAGCTACAACGGCAAAAAATTAAGTGTCGAATAACCTGTCAAAGACGTAAAAAATGAAGGATTACGCCAATGACGTTTAATCCTTCATTGTTATTGTGGCGGGCAC‑AAATTTACGG‑AACAAGGGAACCGTTTTAAAATAAGCCACCGCTAATACCACGC > 1/1713389‑1713874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |