| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 351,526 | A→G | intergenic (‑6603/+60350) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 351,526 | 0 | A | G | 100.0% | 163.8 / NA | 64 | intergenic (‑6603/+60350) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (21/43); total (21/43) | |||||||||||
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ggCTTGATGGCGTAAAATCACCTTACAC‑AAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTGGGGCGATCAAAAACAAATTAAACTCGATTTAAAAGTATTGAGCCTGGTACAATACCGAGCTc < 1:800173/249‑1 (MQ=255) gCTTGATGGCGTAAAATCACCTTACAC‑AAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTgggg < 1:267605/189‑1 (MQ=255) aTGGCGTAAAATCACCTTACAC‑AAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTGGGGCGATCAAAAACAAATTAAACTCGATTTAAAAGTATTGAGCCTGGTACAATACCGAGCTCAATACTTc < 1:418947/251‑1 (MQ=255) | GTGTCTAAACTTTATAAGATTCCTCATTCTCAAGTCATTTATTGGTTAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTGATGGCATAAAATCGCCTTATACTAAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTGGGGCGATCAAAAACAAATTAAACTCGATTTAAAAGTATTGAGCCTGGTACAATACCGAGCTCAATACTTC > 1/351448‑351772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |