| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,663,272 | A→C | intergenic (+21433/+1103) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,663,272 | 0 | A | C | 100.0% | 212.0 / NA | 76 | intergenic (+21433/+1103) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (44/32); total (44/32) | |||||||||||
CCGATAAACAGGAATAAGAAATGCCGTTATTACAAGTGGAAGATTTAACAAAATCCTTTAAGGGTAGCCTCGGCCTCTTTAGCTCCGGCTATTTTCACGCTGTGGAACAAATCAGCTTTAGTCTTGAAGCAGGTAACACCCTGGCAATTATCGGAAGAAACGGTTCAGGAAAATCAACCCTAGCAAAAATGATTGTAGGTATC‑ACAAAACCCACATCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTAGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGCTTTCCGTCAGCCAAAAGCAACGTATCG > 1/1663025‑1663516 | ccGATAAACAGGAATAAGAAATGCCGTTATTACAAGTGGAAGATTTAACAAAATCCTTTAAGGGTAGCCTCGGCCTCTTTAGCTCCGGCTATTTTCACGCTGTGGAACAAATCAGCTTTAGTCTTGAAGCAGGTAACACCCTGGCAATTATCGGAAGAAACGGTTCAGGAAAATCAACCCTAGCAAAAATGATTGTAGGTATC‑ACAAAACCCACATCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTa > 1:333892/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) c‑acaAAACCCACATCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATaa < 1:782742/251‑1 (MQ=255) acaAAACCCACATCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGAt > 1:467502/1‑237 (MQ=255) caAAACCCACATCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATaaaa > 1:33706/1‑251 (MQ=255) caTCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTcc > 1:106591/1‑84 (MQ=255) caTCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAatat < 1:80185/238‑1 (MQ=255) aTCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTCGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGc < 1:346071/251‑1 (MQ=255) ggAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGCttt > 1:172174/1‑250 (MQ=255) cATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATaaaa < 1:802505/232‑1 (MQ=255) gTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTAc > 1:56890/1‑131 (MQ=255) gTTTAAAGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGCt > 1:172902/1‑237 (MQ=255) aaGACAATCCCCTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGCTTTCCGTCAGCCAAAAGCaa < 1:95303/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccccTCGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGCTTTCCGTCAGCCAAAAGCAACGTATCg > 1:412842/1‑250 (MQ=255) | CCGATAAACAGGAATAAGAAATGCCGTTATTACAAGTGGAAGATTTAACAAAATCCTTTAAGGGTAGCCTCGGCCTCTTTAGCTCCGGCTATTTTCACGCTGTGGAACAAATCAGCTTTAGTCTTGAAGCAGGTAACACCCTGGCAATTATCGGAAGAAACGGTTCAGGAAAATCAACCCTAGCAAAAATGATTGTAGGTATC‑ACAAAACCCACATCAGGAAACATCTTGTTTAAAGACAATCCCCTAGTATTCGGCGATTATCATTATCGTGCCAAGCATATTCGCATGGTATTCCAAGATCCGAATACCGCCTTTAATCCGCGTCTAAATGTTGGTCAAGTGCTGGATGCCCCCCTACTTCTCACGACAAAATTTGATGAGCAGCAACGCAATCAGAAAATTTTTGATATTTTAAAACTCGTAGGAATGCACCCGGATCACACTAATATAAAAATCAATACGCTTTCCGTCAGCCAAAAGCAACGTATCG > 1/1663025‑1663516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |