| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,658,146 | T→G | intergenic (+16307/+6229) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,658,146 | 0 | T | G | 100.0% | 159.4 / NA | 58 | intergenic (+16307/+6229) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (30/28); total (30/28) | |||||||||||
CCAGTCGGGTTTCGCTTACACTTCTGGTAGATTGCGGCCAAACAGGCGGTTGCTGCGACAAGGCATTGAGATTGCCATCATAATCAAAACGGGGAACGGATAAATCCGGTTGAGGAATACGTTTTACCGCAATAATCCCGCGCCGCCGCGCCGCATCAAAGAGCGGCAGATGGCTATTATCCACGCGATTGATATGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCTACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGTGCGGTTATTTTCTACGGTGAATACTAAG > 1/1657903‑1658366 | ccAGTCGGGTTTCGCTTACACTTCTGGTAGATTGCGGCCAAACAGGCGGTTGCTGCGACAAGGCATTGAGATTGCCATCATAATCAAAACGGGGAACGGATAAATCCGGTTGAGGAATACGTTTTACCCCAATAATCCCGCGCCGCCGCGCCGCATCAAAGAGCGGCAGATGGCTATTATCCACGCGATTGATATGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCaa > 1:60422/1‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) cgATTGATATGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGt > 1:370145/1‑251 (MQ=255) aTTGATATGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGTg > 1:175014/1‑250 (MQ=255) aTTGATATGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGTg < 1:508358/250‑1 (MQ=255) atatGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCAACCCTGTCACAGCa > 1:413790/1‑72 (MQ=255) 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ggCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGTGCGGTTATTTTCTACGGTGAATACTAAg > 1:899352/1‑251 (MQ=255) gCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCGACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGTGCGGTTATTTTCTACGGTGAATACTaa < 1:235432/249‑1 (MQ=255) | CCAGTCGGGTTTCGCTTACACTTCTGGTAGATTGCGGCCAAACAGGCGGTTGCTGCGACAAGGCATTGAGATTGCCATCATAATCAAAACGGGGAACGGATAAATCCGGTTGAGGAATACGTTTTACCGCAATAATCCCGCGCCGCCGCGCCGCATCAAAGAGCGGCAGATGGCTATTATCCACGCGATTGATATGTAACAATTGGTTAATAAGGCTGGTGATAAAAGCAGTTTTCCCGCTTCTACTCAACCCTGTCACAGCAATGCGTAAAGTGCGGTCTAATCCGCGATTAACCAGATCGTTTAATTCTTTTTGCAAATGATTTAGCATGGTTTTCATTCTTCAGTATTTGTGCAATAGTGCAATAATCATGACGAATATTATACTGAAAAAATGAAGAGAGGCTTAAATTAACAACGTTTCTCCCGAAAAAGTGCGGTTATTTTCTACGGTGAATACTAAG > 1/1657903‑1658366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |