| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,652,438 | C→T | intergenic (+10599/+11937) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,652,438 | 0 | C | T | 100.0% | 173.9 / NA | 65 | intergenic (+10599/+11937) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (35/30); total (35/30) | |||||||||||
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cttATTAACGACGAGGCATTATTGTTACAGCAAGGACAGCATTTTTATTTGTTGTCATTAGCCCGTTTGCAGCATTTAAAATTGGAGTTGAATTTAACCTTGGCGCCAACATCTCAGCCATTGTTAATCCCGATTATTTTTCGCTTATCTAATGACCAATGGCAGGCATGGTTACAACAAAAAACGTTCTTTGAGCAAATCGGTTTTACTTTTACGGAAGAGGCGACACAACATAAAATAACGCTGCaaaa > 1:843278/1‑251 (MQ=255) | GACTACCGGTTATTCCGCCACTGCCTACGCCGAAAAAAAGAATGACGGCACGCAAAAACACCGGCAAAGTTCACCGCACTTTTATCGTGAAAATGCCCATCGTGAACAAATTACGCAGAACGTATTGAATGCCCACAAAACCTTGTGGACGGCGTTAAAAAATCAGCCTCAAACGGAAATGACCATAGCGGAAGTCAGCAAACCCAATACCGATTTTTTACACGCGCTTGCGCTTATCAACGACGAGGCATTATTGTTACAGCAAGGACAGCATTTTTATTTGTTGTCATTAGCCCGTTTGCAGCATTTAAAATTGGAGTTGAATTTAACCTTGGCGCCAACATCTCAGCCATTGTTAATCCCGATTATTTTTCGCTTATCTAATGACCAATGGCAGGCATGGTTACAACAAAAAACGTTCTTTGAGCAAATCGGTTTTACTTTTACGGAAGAGGCGACACAACATAAAATAACGCTGCAAAA > 1/1652201‑1652683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |