| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,645,243 | C→T | intergenic (+3404/+19132) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,645,243 | 0 | C | T | 100.0% | 124.8 / NA | 47 | intergenic (+3404/+19132) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (19/28); total (19/28) | |||||||||||
TTAGAGAAACTGATTGAAAATAAACACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAACTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTACAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTCCATTGGAGAAATTATGCATCTAATTTACTT > 1/1645003‑1645452 | ttAGAGAAACTGATTGAAAATAAACACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAAt > 1:109116/1‑251 (MQ=255) tAAACACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATc < 1:615966/251‑1 (MQ=255) aaaCACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATc > 1:889318/1‑250 (MQ=255) ttATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATcc > 1:526512/1‑250 (MQ=255) aGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAg > 1:474471/1‑251 (MQ=255) gTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATcc < 1:302153/242‑1 (MQ=255) atatTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCg > 1:484032/1‑251 (MQ=255) cGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTAc < 1:615203/250‑1 (MQ=255) cAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGaaa < 1:588490/251‑1 (MQ=255) cAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGaaa < 1:384118/251‑1 (MQ=255) aaCTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCT‑AATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAAt > 1:612233/1‑251 (MQ=255) cTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAAtt > 1:367476/1‑251 (MQ=255) gCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTg < 1:620552/178‑1 (MQ=255) gCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTg < 1:875750/178‑1 (MQ=255) ttATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCa > 1:527250/1‑251 (MQ=255) gCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGGATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCtcatca > 1:49380/1‑248 (MQ=255) cTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACtg < 1:481973/250‑1 (MQ=255) aaaTACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCAc > 1:133504/1‑246 (MQ=255) caGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGaaa < 1:622997/188‑1 (MQ=255) gTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGtt > 1:498748/1‑247 (MQ=255) gTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTaaa > 1:786955/1‑250 (MQ=255) tCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTaa < 1:252451/248‑1 (MQ=255) tAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAAtct < 1:99355/216‑1 (MQ=255) tGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATc < 1:514974/251‑1 (MQ=255) gCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATcc < 1:602090/250‑1 (MQ=255) cATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATcc < 1:748927/249‑1 (MQ=255) cATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATcc < 1:669047/249‑1 (MQ=255) gAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATg > 1:260470/1‑117 (MQ=255) gAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCAc < 1:209845/212‑1 (MQ=255) atttattACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGa > 1:353445/1‑250 (MQ=255) atttattACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGAc < 1:504132/251‑1 (MQ=255) aCCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTc < 1:872801/251‑1 (MQ=255) aCCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTc < 1:59922/251‑1 (MQ=255) ggTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGtt > 1:482109/1‑213 (MQ=255) gTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTaa < 1:534541/221‑1 (MQ=255) gTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATcc < 1:218803/224‑1 (MQ=255) ttATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATg < 1:48246/251‑1 (MQ=255) aTTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGaa > 1:128922/1‑251 (MQ=255) ttGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAAt < 1:20262/251‑1 (MQ=255) aaCATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTCCATTGgag < 1:39516/251‑1 (MQ=255) aCATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACcac > 1:566947/1‑238 (MQ=255) ggTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTCCATTGGAGAAATTATGCAt > 1:771525/1‑247 (MQ=255) gTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTcc < 1:439598/228‑1 (MQ=255) gTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATAcc > 1:247419/1‑215 (MQ=255) tACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTCCATTGGAGAAATTATGCATCTAATTTACtt < 1:559951/250‑1 (MQ=255) ctctTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACcac < 1:501380/210‑1 (MQ=255) aTCAATGCCCGAATTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTGCAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTCCATTGgag < 1:13694/201‑1 (MQ=255) | TTAGAGAAACTGATTGAAAATAAACACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTAAGTACAGCCTCTTGGACAAGAGTTTTAACATCAATGCCCGAACTGGAATCAATGACTGTTATTGAATTAAATCCGGGCTATCCTCAGCTAGCCGGAATGTACTCTGAAATGGGCAAATTTCTACAGGACAAGCGGGTCAATCTCATCACTGATGATGGTCGCCGTTGGTTAAACCGTAATCCTGAGAAAAAATTTGACTTTATTCTAATGAATACCACATTCCATTGGAGAAATTATGCATCTAATTTACTT > 1/1645003‑1645452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |