| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,644,954 | G→A | intergenic (+3115/+19421) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,644,954 | 0 | G | A | 100.0% | 84.3 / NA | 33 | intergenic (+3115/+19421) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (18/15); total (18/15) | |||||||||||
AAAAAAACAGGTGCAGCAATTTCTAATGTCTATTTTGCTAATGTTCTGGGATGTACAATTTCTCCGATATTAATTGGATTTTACCTCCTTGACATTTTTACTACACAACAAACATATTTTATCATCACTTTTATTACCCTGGTTACAGCTGCATTCTGTATACAAGAAAAATGGCTAAAAAGCACAACCGCTCTTATAGCTACTATTATTATAGCGATAACCTTCGTTTTACCTGAAAATATGATTCATTCATTAGCCAAGAAAAAAGATGAAAACGGGAAATATTTAAAATTAGAGAAACTGATTGAAAATAAACACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTA > 1/1644712‑1645200 | aaaaaaaCAGGTGCAGCAATTTCTAATGTCTATTTTGCTAATGTTCTGGGATGTACAATTTCTCCGATATTAATTGGATTTTACCTCCTTGACATTTTTACTACACAACAAACATATTTTATCATCACTTTTATTACCCTGGTTACAGCTGCATTCTGTATACAAGAAAAATGGCTAAAAAGCACAACCGCTCTTATAGCTACTATTATTATAGCGATAACCTTCGTTTTACCTGAAAATATAattcattc < 1:487885/251‑1 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AAAAAAACAGGTGCAGCAATTTCTAATGTCTATTTTGCTAATGTTCTGGGATGTACAATTTCTCCGATATTAATTGGATTTTACCTCCTTGACATTTTTACTACACAACAAACATATTTTATCATCACTTTTATTACCCTGGTTACAGCTGCATTCTGTATACAAGAAAAATGGCTAAAAAGCACAACCGCTCTTATAGCTACTATTATTATAGCGATAACCTTCGTTTTACCTGAAAATATGATTCATTCATTAGCCAAGAAAAAAGATGAAAACGGGAAATATTTAAAATTAGAGAAACTGATTGAAAATAAACACGGTTTTATTCAAGTATATTTAAGCGAAAACAATGACAAACTCGTATTCGGCGGTAATGCTTATGATGGTATGCTAAATACAAATTTGAATCACAGTCATAATGGCATTGAAAGAGCTTATTTATTACCGGTTATTGCACCTCATGCGAAAAACATTCTTGTTATCGGTTTA > 1/1644712‑1645200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |