| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,633,589 | A→C | intergenic (‑188961/‑8175) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,633,589 | 0 | A | C | 100.0% | 156.7 / NA | 57 | intergenic (‑188961/‑8175) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (31/26); total (31/26) | |||||||||||
GTGCCTTCTCTCCAATTCGCGCTTGGCTTAATAATTGTTCAACCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGAGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATACGCCCCGTTGGTCACAATGCCTTCATGTGGCGACAAATATTGTGGCAACAGGCTGATATGCGCCAGCATTTGCG > 1/1633342‑1633833 | gTGCCTTCTCTCCAATTCGCGCTTGGCTTAATAATTGTTCAACCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGGATTGCGtt > 1:258774/1‑251 (MQ=255) ttCTCTCCAATTCGCGCTTGGCTTAATAATTGTTCAACCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATc < 1:375293/251‑1 (MQ=255) cTTGGCTTAATAATTGTTCAACCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCgg < 1:72654/250‑1 (MQ=255) gCTTAATAATTGTTCAACCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGAt > 1:66010/1‑230 (MQ=255) aataatTGTTCAGCCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTtgc > 1:453115/1‑237 (MQ=255) gTTCAACCGGCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTTAAAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACAt > 1:885336/1‑250 (MQ=255) gCGTTTGCTCCCACCGGCTGTCGATGGTTTGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTATAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGgcg > 1:430469/1‑248 (MQ=255) 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tttGCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGa < 1:240332/251‑1 (MQ=255) gCATGGAAATTGGTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGa > 1:617512/1‑248 (MQ=255) gTAAAAAATTATCCGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTa > 1:540401/1‑251 (MQ=255) ccGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACtttt > 1:73822/1‑251 (MQ=255) cGTTAAAGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACttttt < 1:573532/251‑1 (MQ=255) aaGGAATCCTGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACttttt > 1:756156/1‑246 (MQ=255) tGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAatat < 1:262026/251‑1 (MQ=255) tGTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAatat < 1:471882/251‑1 (MQ=255) gTTTTTACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTTCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTtttcttt > 1:698392/1‑240 (MQ=255) ttttACTTTCCGGCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGc < 1:603682/251‑1 (MQ=255) ggCAATAAACTGCGGGCAGATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCtttt > 1:505049/1‑250 (MQ=255) gATGTCATCATTGCCAATGCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGAtt < 1:352721/248‑1 (MQ=255) 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gCCTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAatat > 1:807874/1‑201 (MQ=255) cTTACGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGAt > 1:60465/1‑251 (MQ=255) cGCACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATACGc < 1:814864/251‑1 (MQ=255) cACCGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATACGccc < 1:350222/251‑1 (MQ=255) ccGGGCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATACGCCCCg > 1:274361/1‑251 (MQ=255) ggCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATACGCCCCGTTg > 1:298802/1‑251 (MQ=255) gCTTTGCGCCAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTa > 1:830672/1‑110 (MQ=255) 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ccAGTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTc < 1:816620/134‑1 (MQ=255) gTTGTGGCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATAc > 1:247331/1‑230 (MQ=255) gCGTGTT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATCCACATTTTTAAACGCCACTTTTTCTTTCGCCCAATATTGCGGGTTCTTTTCCAAATGGATGAGATTGCCTTGCTGCCCCATCACTTGATACGCCCCGTTGGTCACAATGCCTTCAtg < 1:128386/250‑1 (MQ=255) gtgtT‑AAAATTAAAGGTGTAAAAATAGGTGCAAAGTTGCGGGAAGTATTGCGTTTGATCCGTTTGTTGCTGCGGCTGCCACACCACATCTAAGGCGCTGACGTCCTGTTGCAGTGCGATTTTCTGATAATcc < 1:702359/132‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |