| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,625,924 | A→G | intergenic (‑181296/‑15840) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,625,924 | 0 | A | G | 98.2% | 129.3 / NA | 55 | intergenic (‑181296/‑15840) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (30/24); minor base T (0/1); total (30/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATCTTGCCAATGTAGTTCCGTCGGCAGAAAATCCACGAAATAAATACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGACTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACGGATCTACGGTTTTCAGT > 1/1625682‑1626145 | caTCTTGCCAATGTAGTTCCGTCGGCAGAAAATCCACGAAATAAATACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑t > 1:656192/1‑249 (MQ=255) tGCCAATGTAGTTCCGTCGGCAGAAAATCCACGAAATAAATACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTa > 1:21238/1‑250 (MQ=255) aTGTAGTTCCGTCGGCAGAAAATCCACGAAATAAATACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTAc < 1:434604/246‑1 (MQ=255) aTGTAGTTCCGTCGGCAGAAAATCCACGAAATAAATACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCa > 1:638972/1‑251 (MQ=255) aTCCACAAAATAAATCCCTTCGAACAACAATTTCTTCCCAATGGCTTTTCCC‑AATAACTAAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCAAAAATCATCCAAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GC‑GGC‑TTTCAAGCCCCGCCTGCAAGCCGTACCAAAAAAAAATCCGTTTAATGAAGCGGTTTTTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATTTCGCCGGTTTTG‑TTTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGt < 1:384625/251‑1 (MQ=255) aaaaaaaatcccgccggaaaaaattttCTTACAAAGGGCTTTTTCA‑AAAAACAAAATAAATTGAGAAAGATTAAAGGCAAAAACCATCCAAAA‑CA‑AAAGCCAAATCAG‑‑‑GCACCT‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACAAAATAAAAACCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAAc < 1:180965/227‑1 (MQ=255) aaaaaaaataCCGTCGAAAAAAAATTTCTTCCAAATGGC‑TTTTCCAAAAAACTAAATAAATTGAGTCAATTTAAAGGCAAAAATCAT‑CCAAACCCCAAT‑CC‑AAACCA‑‑‑GCCGCCTTTTCAGC‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAACCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGGGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGTTTTT‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAAc < 1:833382/246‑1 (MQ=255) aaataaatACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTAc < 1:821101/218‑1 (MQ=255) aaataaatACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACa > 1:781901/1‑251 (MQ=255) aaataaatACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACa > 1:698415/1‑251 (MQ=255) aaataaatACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACa > 1:537902/1‑251 (MQ=255) aaataaatACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACa > 1:560034/1‑251 (MQ=255) aaataCCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCg > 1:589607/1‑251 (MQ=255) acaaaattttttaacaaaTGGC‑TTTTCCAAAAAACTAAATAAATGGAGTAAGATCAAAGGCAAAAATCACGCAAAA‑CAAAATCCA‑AATCAG‑‑‑GCACCT‑TTTCAGG‑CCCGCCTGCAGGCCGTACCAAAAAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATGGGCGCCGAGGGTGCGCAAAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAAcc < 1:432905/235‑1 (MQ=255) caacaaTTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAAc > 1:96213/1‑222 (MQ=255) aTTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAGGCAGCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCaa > 1:676927/1‑250 (MQ=255) tACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCg > 1:210898/1‑251 (MQ=255) tACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCg > 1:19876/1‑251 (MQ=255) ccAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTAc < 1:729694/188‑1 (MQ=255) ccAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGat > 1:672716/1‑251 (MQ=255) ggcttttCCAAATAACTAATTTATTTGAGTAATATTCAAGGAAAAAATCATGCCAAA‑CAAAATGCA‑AATCGG‑‑‑GCACCT‑TTTCATG‑CCCGCCGGCAAGCCGTACCAAATAAAAACCCGTTTAATAAAACGGTTTTTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGAAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATAc < 1:708832/247‑1 (MQ=255) ctaaattaattGAGTCAAATTCAGGGCAAAAACCAGGCAAAA‑CACAATGCA‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATC‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGTTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TC‑TTTACCGCCATAATTAAAg < 1:881558/178‑1 (MQ=255) ttcatattaagggaaaaaaTCATCCCAAA‑CAAAATCCC‑AATCAG‑‑‑CCACCC‑TTGCGGC‑CCCGCCTGCAAGCCGTACAAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCAAAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATcgc < 1:763705/235‑1 (MQ=255) gTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAAc > 1:159778/1‑187 (MQ=255) aTGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTg > 1:362791/1‑249 (MQ=255) tGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTAc > 1:779107/1‑133 (MQ=255) gCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAAc > 1:618943/1‑164 (MQ=255) gCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATc > 1:502229/1‑214 (MQ=255) gCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGa > 1:280880/1‑251 (MQ=255) gCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGATTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTAc < 1:356454/132‑1 (MQ=255) a‑cacAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGCGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAAc > 1:400853/1‑159 (MQ=255) cAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACa > 1:13790/1‑251 (MQ=255) cacccagtcacccttgcttccccGCGTGCACGCCGTACAAAATAAAAATCCGTTTAATAAAAGGGTTATGGGCGCCGGGGGTGCGCAAAATGGAAATATCGCCGGTTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAgg < 1:887472/231‑1 (MQ=255) cgccctttcaagg‑CCCGCCGGAAAGCGGTACAAAATAAAAATCCGTTAAATGAAGGGGTTATTGGCGCCGGGGGTGCGAAAAGTGGCAATACCGCTGGCTTTG‑TCTTTAACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGc < 1:156825/238‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAAt > 1:68127/1‑246 (MQ=255) ccTGCAAGCCGTACAAAAAAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATGGGCGCCGGGGGTGCGCATAATGGAAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTg < 1:493901/181‑1 (MQ=255) 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acaaaaaaaaaaTCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCGGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGTTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGaataa < 1:472526/244‑1 (MQ=255) aTAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAAc > 1:377639/1‑237 (MQ=255) aTAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCat > 1:590393/1‑251 (MQ=255) aaaaTCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATAtt > 1:575302/1‑251 (MQ=255) aatgtgtataagagcggggtttATGGGCGCCGGGGGTGCGCATAATGGCAATATCG‑CGGTTTTGTTCTTTAACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATAttt < 1:857003/231‑1 (MQ=255) ttaaaTGAACCGGTTTTGGGCGCGGAGGGTGCGCATAATGGCATTATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGGAACATGGAATAATCCATATTTTGCacac < 1:856660/248‑1 (MQ=255) aaaCGGTTATTGGCGCCGGGGGTGCTCATAATGGCAATACCCCCGTCTTTT‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACgg < 1:804794/251‑1 (MQ=255) aaCGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACGGa < 1:32598/251‑1 (MQ=255) ggTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGTTTTG‑TTTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGcac < 1:750105/238‑1 (MQ=255) gTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACGGAt > 1:701645/1‑248 (MQ=255) gggggTGCGAATAATGGCAATACCGCCGGTTTTG‑TTTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACGGATCTGCGGTTTTCAGt < 1:696168/248‑1 (MQ=255) ggggTGCGCATATTGGAAATATCGCGGGTTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACaa < 1:483848/63‑1 (MQ=255) gcgcATAATGGAAATACCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCAc < 1:460536/108‑1 (MQ=255) cATAATGGCAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGatat > 1:592735/1‑98 (MQ=255) cAATATCGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATAc > 1:891040/1‑92 (MQ=255) cGCCGGCTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACACCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACGGa > 1:403696/1‑212 (MQ=255) | CATCTTGCCAATGTAGTTCCGTCGGCAGAAAATCCACGAAATAAATACCGTCGGACAACAATTTCTTACCAATGGCGTTTTCC‑AATAACTGAATTAATTGAGTCAGATTCAAGGCTAAAATCATGCCAAA‑CACAATGCC‑AATCAG‑‑‑GCAGCC‑TTTCATG‑CCCGCCTGCAAGCCGTACCAAATAAAAATCCGTTTAATGAAACGGTTATTGGCGCCGAGGGTGCGCATAATGGCAATATCGCCGACTTTG‑TCTTTTACCGCCATAATTAAAGTGGAAACAATGTTAAAACAGGCGACCCCGATAACCAACACCATGGCGATATACATCACCGTGCGGATCAGCTGAATATCGCGGTACATATAACCAAATTTGCTGATCCAGTTTTGCAGGTACAGCATCTGCGGATAATCCTGCAACATGGAATAATCCATATTTTGCACACTAAACGGATCTACGGTTTTCAGT > 1/1625682‑1626145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |