| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,613,945 | G→A | intergenic (‑169317/‑27819) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,613,945 | 0 | G | A | 100.0% | 138.2 / NA | 50 | intergenic (‑169317/‑27819) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (29/21); total (29/21) | |||||||||||
AAAGATAACAAAGATCAATACATAGATATCACTATTTGGGATAAAAATTTATTTATTAGGGGTATTGTAAATTCCTTTCATGAAGATAAAGAACTATTCGAAATATACATTGAAAATGCTGATGTTTATAAAACATCAAAAGGTAAAGCAACAAAAATTTACACAGCTCTTAGACTTTCAATATGTGAGCCATATAAAAACCTTATAATTTCAACTACACAACAACCTTCAAAAGGAGAATAGATATGAGATATAACCAAAACCATGAAGCCATTGTAATGGATGGTATAACATTAAGAACCACAAATGAAAGATTATCCACAGAAAACTATAAATTAAAGTCAGATGATTTTAATATAAAGGTTAGGGAACAACAGTCTGCTCCAGTAAAACCCACAACTCCTCCTGTTAGTCATAAATAGTTAAGTTAAATAGGTAAATACTATGGCATACAC > 1/1613710‑1614164 | aaaGATAACAAAGATCAATACATAGATATCACTATTTGGGATAAAAATTTATTTATTAGGGGTATTGTAAATTCCTTTCATGAAGATAAAGAACTATTCGAAATATACATTGAAAATGCTGATGTTTATAAAACATCAAAAGGTAAAGCAACAAAAATTTACACAGCTCTTAGACTTTCAATATGTGAGCCATATAAAAACCTTATAATTTCAACTACACAACAACCTTCAAAAGAAGAATAGATATgaga < 1:180851/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |