| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,613,512 | G→A | intergenic (‑168884/‑28252) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,613,512 | 0 | G | A | 100.0% | 52.4 / NA | 21 | intergenic (‑168884/‑28252) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (6/15); total (6/15) | |||||||||||
GAGGGATTAGATTACTCTTAGCGAGTTCATATGAATGAATTGACAATAAAAATTGTAATGCTCTTTTATTACCTGGCATTATAATTACAATGCTTATAGATAAGTTCACTGAACATAAAGAATGGAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATGCAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATACCTTGCCAAATTTCTTCTTAAATTTAATATTTCTAGAAAATATGGTGATTATGGAGTATTCCCCCAGTTATTAAAAGATAACAAAGATCAATACATAGATATCACTATTTGGGATAAAA > 1/1613264‑1613755 | gAGGGATTAGATTACTCTTAGCGAGTTCATATGAATGAATTGACAATAAAAATTGTAATG‑‑CTTTTATTACCTGGCATTATAATTACAATGCTTATAGATAAGTTCACTGAACATAAAGAATGGAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACag < 1:185737/250‑1 (MQ=255) attaCTCTTAGCGAGTTCATATGAATGAATTGACAATAAAAATTGTAATG‑‑CTTTTATTACCTGGCATTATAATTACAATGCTTATAGATAAGTTCACTGAACATAAAGAATGGAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCa < 1:173441/250‑1 (MQ=255) gCTTATAGATAAGTTCACTGAACATAAAGAATGGAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAg > 1:676295/1‑173 (MQ=255) cATAAAGAATGGAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGt < 1:309196/142‑1 (MQ=255) gAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATAc < 1:544605/250‑1 (MQ=255) cTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGt < 1:294448/222‑1 (MQ=255) cTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTAACGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGt < 1:776424/125‑1 (MQ=255) taAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGtt < 1:888326/142‑1 (MQ=255) atatGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAacctacct > 1:501123/1‑139 (MQ=255) gAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATc < 1:717948/201‑1 (MQ=255) aaTATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATACCTTGCCAAATTTCTTCTTAAATTTAATATTTCTAGAAAat < 1:182332/251‑1 (MQ=255) atatTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACag < 1:340527/73‑1 (MQ=255) ttCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGa < 1:699456/82‑1 (MQ=255) cTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAACTTTCACATTAAATAATACAGAGt > 1:676877/1‑58 (MQ=255) cTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGt < 1:719843/58‑1 (MQ=255) cTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAacc < 1:18652/94‑1 (MQ=255) cTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATAc > 1:870053/1‑177 (MQ=255) ggTACGAAAATTTCACATTAAATAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATACCTTGCCAAATTTCTTCTTAAATTTAATATTTCTAGAAAATATGGTGATTATGGAGTATTCCCCCAGTTATTAAAAGATAACAAAGATCAATACATAGa < 1:99653/250‑1 (MQ=255) aaaTAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAacctacc < 1:470286/54‑1 (MQ=255) aaaTAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATACCTTGCCAAATTTCTTCTTAAATTTAATATTTCTAGAAAATATGGTGATTATgg > 1:744004/1‑186 (MQ=255) aaaTAATACAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATACCTTGCCAAATTTCTCCTTAAATTTAATATTTCTAGAAAATATGGTGATTATGGAGTATTCCCCCAGTTATTAAAAGATAACAAAGATCAATACATAGATATCACTATTTGGGATaaaa > 1:758324/1‑251 (MQ=255) ataataCAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATa < 1:118343/116‑1 (MQ=255) | GAGGGATTAGATTACTCTTAGCGAGTTCATATGAATGAATTGACAATAAAAATTGTAATGCTCTTTTATTACCTGGCATTATAATTACAATGCTTATAGATAAGTTCACTGAACATAAAGAATGGAATAACTATAAATATTCATTGTTTGTTATTTCATATGGAATATTATCTTACTTAATATTACAAATTCTATCGCTATTAAATCAATGTGCCAAAATCGGGTACGAAAATTTCACATTAAATAATGCAGAGTATCTTCAAGTATGGGATGTTAATTCAAGTATTAACCTACCTTATAATGAAGTAATTGCTTCAGGAATAGTGTCATTTTTTCTTGGTTTATTATTTGTTTACATAGATCACAAAGAATACCTTGCCAAATTTCTTCTTAAATTTAATATTTCTAGAAAATATGGTGATTATGGAGTATTCCCCCAGTTATTAAAAGATAACAAAGATCAATACATAGATATCACTATTTGGGATAAAA > 1/1613264‑1613755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |