| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,599,563 | C→T | intergenic (‑154935/‑42201) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,599,563 | 0 | C | T | 100.0% | 187.3 / NA | 69 | intergenic (‑154935/‑42201) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/35); total (34/35) | |||||||||||
TATGTGGAACCTGTCCGAGCCGTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAACGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGGTCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTACCAA > 1/1599323‑1599806 | actgtgGACCCTGTCCGAGCCGTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGt < 1:241019/249‑1 (MQ=255) aTGTGGAACCTGTCCGAGCCGTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTc < 1:856191/251‑1 (MQ=255) aTGTGGAACCTGTCCGAGCCGTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCCTCAAAATTTTTC‑ACGGCAAAAATAACATTTACGACATCGGCGGAAACAAACAAAGG‑TCACAAAAAAACCCGCAATTCGTGGGGGATATTGGGGAAAAA‑AAAAACATCACCGCCCCTATGGACTATGCCATCCCGGGAGCGGGATTTTAAAAAAGCGATGCGGCGGTAAACAATAATGGTCCtttgg > 1:746765/1‑247 (MQ=255) acccTGTCCGAGCCGTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTgggg < 1:102180/249‑1 (MQ=255) gTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTgaga < 1:242729/248‑1 (MQ=255) cTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTAc < 1:81208/251‑1 (MQ=255) aTCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACgg < 1:163025/251‑1 (MQ=255) ggTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTgaga < 1:121212/214‑1 (MQ=255) ggTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGa > 1:365906/1‑250 (MQ=255) ccTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACgg > 1:135822/1‑226 (MQ=255) cTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACg < 1:494118/251‑1 (MQ=255) tttGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACaa > 1:224602/1‑251 (MQ=255) aaCGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCaa < 1:187181/251‑1 (MQ=255) gCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAG‑AAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCg < 1:72988/250‑1 (MQ=255) atatGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAAtt > 1:201988/1‑200 (MQ=255) atatGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACg < 1:154498/230‑1 (MQ=255) atatGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTtcg > 1:808436/1‑251 (MQ=255) aCATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCgg > 1:343674/1‑250 (MQ=255) aCATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCgg > 1:499255/1‑250 (MQ=255) cATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATcac < 1:451145/229‑1 (MQ=255) aTTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAAc < 1:727032/238‑1 (MQ=255) aCATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGt > 1:674356/1‑251 (MQ=255) cATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTg < 1:856649/251‑1 (MQ=255) ggCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCgg > 1:337520/1‑251 (MQ=255) cGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTa < 1:635447/251‑1 (MQ=255) c‑aacGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTaa > 1:360468/1‑249 (MQ=255) ggTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAg > 1:626965/1‑251 (MQ=255) aaGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTgaga > 1:462990/1‑141 (MQ=255) gCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAAc < 1:223779/183‑1 (MQ=255) gCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAAc < 1:858590/231‑1 (MQ=255) cccTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGa < 1:337973/250‑1 (MQ=255) tGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGaa < 1:570426/251‑1 (MQ=255) aaaaTAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTa > 1:75034/1‑250 (MQ=255) aaaaTAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTa > 1:339921/1‑250 (MQ=255) aaaaTAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTAc < 1:426425/251‑1 (MQ=255) aaaaTAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTAc < 1:387707/251‑1 (MQ=255) gTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGt < 1:546675/247‑1 (MQ=255) tcatcaGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGAcc < 1:426319/251‑1 (MQ=255) cgcCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGAc < 1:309321/250‑1 (MQ=255) gATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTc < 1:182476/185‑1 (MQ=255) gATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGa > 1:242752/1‑203 (MQ=255) gATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGAtct > 1:377200/1‑206 (MQ=255) gATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGttt > 1:48904/1‑251 (MQ=255) gATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAATGCCGGCATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGttt > 1:428079/1‑251 (MQ=255) ggACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGGGGTGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGGAACATTGAAAAAAGCAAAAACAAATACGGCGTTGCCGTGTTGCCGGCCTTAAACGATCACAATGGCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGAt < 1:644637/199‑1 (MQ=255) ggACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCg > 1:467269/1‑107 (MQ=255) gACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGaaa > 1:175746/1‑250 (MQ=255) gACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGaaa > 1:23194/1‑250 (MQ=255) gACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGaaa > 1:562748/1‑250 (MQ=255) aCTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGTGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAAc < 1:765377/250‑1 (MQ=255) aCTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAAc < 1:519786/250‑1 (MQ=255) cTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCg > 1:329043/1‑251 (MQ=255) ccATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAAt < 1:463021/251‑1 (MQ=255) cgGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGAc < 1:147925/251‑1 (MQ=255) gAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACaa > 1:657928/1‑251 (MQ=255) gCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCa > 1:300406/1‑249 (MQ=255) aaCAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAAc < 1:448536/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTg < 1:642964/251‑1 (MQ=255) gcgTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGAc < 1:552452/80‑1 (MQ=255) gcgTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTAt > 1:571376/1‑131 (MQ=255) gcgTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAAt > 1:881019/1‑250 (MQ=255) gTTAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAAc < 1:541474/133‑1 (MQ=255) tAACCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTAc < 1:296331/251‑1 (MQ=255) aaCCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAAc > 1:272727/1‑130 (MQ=255) aaCCATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTAc > 1:145745/1‑250 (MQ=255) ccATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGAt > 1:67863/1‑149 (MQ=255) ccATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTACCaa > 1:131955/1‑251 (MQ=255) ccATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGAAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTACCaa > 1:108996/1‑251 (MQ=255) ccATTAATGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGATCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACACCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTACCaa > 1:415300/1‑251 (MQ=255) | TATGTGGAACCTGTCCGAGCCGTATTTCACTTGGCCTATCGTCGCTTCTAACGGCGGTTATGCCTTC‑AAATTTGTCAACGGCAAATATGACATTAACGACATCGGCGTAAAC‑AACGAAGGTTCACAAAAAGCCCTGCAATTCGTGGTGAATA‑TGGTGAAAAATAAAGTCATCAGCGCCGATATGGACTATGCCATCGCGGAAGCGGCATTTAACAAAGGCGATGCGGCGTTAACCATTAACGGTCCTTGGTCTTGGGGCAACATTGAGAAAAGCAAAATCAATTACGGCGTTGCCGTGTTGCCGACCTTAAACGGTCACAATGCCAAACCGTTCGTCGGCGTGTTAAGTGCCGGTATTAACTCCGCCAGCCCGAACAAAGATCTCGCGGTGGAATTCATGGAAAACTACCTGTTGACCGATGACGGTTTGGAAACCGTCAATAAAGACAAACCACTAGGCGCTGTGGCATTGAAATCCTACCAA > 1/1599323‑1599806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |