| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 345,306 | C→T | intergenic (‑383/+66570) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 345,306 | 0 | C | T | 100.0% | 253.0 / NA | 92 | intergenic (‑383/+66570) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (48/44); total (48/44) | |||||||||||
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> 1:703355/1‑193 (MQ=255) cGGGTAATCCCCACATACGTCAAACGACGCTCTTCTTCCACATTGTCTTTGTCAATGCTGGTTTGGTGCGGCAAAATACCTTCTTCCATGCCAATTAAAAACACATGGGGAAATTCCAGCCCTTTGGAGGCGTGTAGCGTCATCAATTGCACCTGGTCGCCATCATTTTCCTCTTCGCCGCGCTCCAGCATATCCCGTAAGGTCAAGCGGGTGACAATTTGATTGAGGTTCATGGGCt > 1:613110/1‑238 (MQ=255) gggTAATCCCCACATACGTCAAACGACGCTCTTCTTCCACATTGTCTTTGTCAATGCTGGTTTGGTGCGGCAAAATACCTTCTTCCATGCCAATTAAAAACACATGGGGAAATTCCAGCCCTTTGGAGGCGTGTAGCGTCATCAATTGCACCTGGTCGCCATCATTTTCCTCTTCGCCGCGCTCCAGCATATCCCGTAAGGt > 1:21784/1‑202 (MQ=255) ggTAATCCCCACATACGTCAAACGACGCTCTTCTTCCACATTGTCTTTGTCAATGCTGGTTTGGTGCGGCAAAATACCTTCTTCCATGCCAATTAAAAACACATGGGGAAATTCCAGCCCTTTGGAGGCGTGTAGCGTCATCAATTGCACCTGGTCGCCATCATTTTCCTCTTCGCCGCGCTCCAGCATATCCCGTAAGGTCAAGCGGGTGACAATTTGATTGAGGTTCATGGGCTCGTTAAACtcgtcg > 1:805955/1‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCTTTGTCAATGCTGGTTTGGTGCGGCAAAATACCTTCTTCCATGCCAATTAAAAACACATGGGGAAATTCCAGCCCTTTGGAGGCGTGTAGCGTCATCAATTGCACCTGGTCGCCATCATTTTCCTCTTCGCCGCGCTCCAGCATATCCCGTAAGGTCAAGCGGGTGACAATTTGATTGAGGTTCATGGGCTCGTTAAACTCGTCGCCTTTCAACATGCCGGCGACCCAATCGAACAGCATCGCCACGt > 1:602836/1‑251 (MQ=255) tCTTTGTCAATGCTGGTTTGGTGCGGCAAAATACCTTCTTCCATGCCAATTAAAAACACATGGGGAAATTCCAGCCCTTTGGAGGCGTGTAGCGTCATCAATTGCACCTGGTCGCCATCATTTTCCTCTTCGCCGCGCTCCAGCATATCCCGTAAGGTCAAGCGGGTGACAATTTGATTGAGGTTCATGGGCTCGTTAAACTCGTCGCCTTTCAACATGCCGGCGACCCAATCGAACAGCATCGCCACGt < 1:19051/250‑1 (MQ=255) | CGTAAAATTGCCCGTAAATTGGCGATATGGCTTTGTGTTTTTGCCTGTTGCTGTTCGGCGCTTAACGGCGGTTTATCCCGCTCCCATTGCAAATCGTTTTCCGGCAGTTCCAACAAAAAGCGACTCGGTTCGGGACGGATTAACTCGCCGAATTGACGTCGTTCCTTACACAAGGAAAACCACAGATTCTGTTGCGCACGGGTAATCCCCACATACGTCAAACGACGCTCTTCTTCCACATTGTCTTCGTCAATGCTGGTTTGGTGCGGCAAAATACCTTCTTCCATGCCAATTAAAAACACATGGGGAAATTCCAGCCCTTTGGAGGCGTGTAGCGTCATCAATTGCACCTGGTCGCCATCATTTTCCTCTTCGCCGCGCTCCAGCATATCCCGTAAGGTCAAGCGGGTGACAATTTGATTGAGGTTCATGGGCTCGTTAAACTCGTCGCCTTTCAACATGCCGGCGACCCAATCGAACAGCATCGCCACGT > 1/345059‑345551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |