| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 341,479 | 0 | T | C | 100.0% | 223.4 / NA | 78 | intergenic (‑74119/+3126) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
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ttattGTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACcg < 1:703765/230‑1 (MQ=255) ttattGTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCg > 1:118625/1‑251 (MQ=255) ttattGTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCg > 1:44672/1‑251 (MQ=255) gTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTta > 1:112354/1‑175 (MQ=255) gTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATcc > 1:358736/1‑231 (MQ=255) gTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCGATTTg > 1:387230/1‑251 (MQ=255) gTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCGATTTg > 1:365418/1‑251 (MQ=255) 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gagaTTTGCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACg < 1:803805/137‑1 (MQ=255) gCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTAc < 1:814281/112‑1 (MQ=255) gCCTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCGATTTGATGTGCTTCTTCCAAAGAATGCTCGgtgt > 1:639714/1‑251 (MQ=255) ccTTCCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCGATTTGATGTGCTTCTTCCAAAGAATGCTCGGTGTa > 1:307681/1‑251 (MQ=255) | TCCGGCACCCGATCACCGGCGAAACCATGGAATTCACCACACTGGTCGGGTTTTAAAAAGTGCGGTGGATTTTTCCTGTGTTTTTTCGATGTGAAACACCTAAAATTCCGACCGCACTTTTCTTTTCCGAGGCGATAAAAAGCAATGAAACGGGTTCATTGCTTTGGTTGTCTTTATTGTATTGCCAAATATTTTTCTTTTTCAATTATTGTCCTTATCATTCCGATCTTTTGAGATTTGCCTTTCATGATGGCGGGCCGGAAGGGGACAGGCTGATGAAGTTGGCGATTAGAACCGGCAATCCGAATCCTTCTGCCACTAAAAAATGACGAATGCTTTCAGGTTATGTACCGATGGTGGTCATAAACGTCTCCTTATTGTTTTAATAAGCTTTCGTCTAAGGTTAAATCTTCATTTTTATTTACGCCGATACCGCGATCCAACACATTTTGTGCGATTTGATGTGCTTCTTCCAAAGAATGCTCGGTGTA > 1/341235‑341725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |