| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,567,982 | A→G | intergenic (‑123354/‑73782) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,567,982 | 0 | A | G | 100.0% | 278.1 / NA | 99 | intergenic (‑123354/‑73782) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (54/45); total (54/45) | |||||||||||
CTCGGTATCGTAGCCTGTATCGGTTATATTCTGTTAAGAAAAGACACAGCAACTATTATCAAAGGCACGATTAAAACCATCGTGGGCTTTATGTTGGTACAAGTGGGGGCGGCCACATTGGTTGCCGGTTTTAAACCAATTATTGAAAATCTGGCAAAGTTCCATAATTTAACCGGTGCAGTCATTGACCCTTACACCAGCATGCAGGCGACCATCCAAACCATGGGAGATAACTACGGTTGGGTCAGCTATGCCGTATTATTGGCACTGGCATTGAACATTTTATTAGTGGTATTCAGACGCTTTACCGGTATTCGTACCATCATGCTTACCGGCCATATCATGTTCCAGCAGGCGGGTTTGGTTGCGGTGTTCTATATGATCATCGGTGCTTCCATGTGGGAAACCATCGTTTATACAGCAGTCATCATGGCATTATATTGGGGGATTTCCTCTAACATTATGTATAAAGCAACCCAATCAGTTACCGGC > 1/1567736‑1568227 | cTCGGTATCGTAGCCTGTATCGGTTATATTCTGTTAAGAAAAGACACAGCAACTATTATCAAAGGCACGATTAAAACCATCGTGGGCTTTATGTTGGTACAAGTGGGGGCGGCCACATTGGTTGCCGGTTTTAAACCAATTATTGAAAATCTGGCAAAGTTCCATAATTTAACCGGTGCAGTCATTGACCCTTACACCAGCATGCAGGCGACCATCCAAACCATGGGAGATAACTACGGTTGGGTCGGCTa < 1:405196/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |