| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,564,986 | C→T | intergenic (‑120358/‑76778) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,564,986 | 0 | C | T | 100.0% | 249.1 / NA | 90 | intergenic (‑120358/‑76778) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (46/44); total (46/44) | |||||||||||
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cGATGCCCAGCTTCAATTCTTTCGCGACGTTGTCATTCCACGCACTTAAATTGCCGAGATCCGGATACACAGTGAACCACGGCGATTTGATAAGGTCATCCCATTTTTTCCAGCGACTGATGGAGCTCATAAATTGGGTATCCATAATTTCTACCGCAATGGTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATac < 1:295270/251‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTCAATTCTTTCGCGACGTTGTCATTCCACGCACTTAAATTGCCGAGATCCGGATACACAGTGAACCACGGCGATTTGATAAGGTCATCCCATTTTTTCCAGCGACTGATGGAGCTCATAAATTGGGTATCCATAATTTCTACCGCAATGGTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATac > 1:646597/1‑247 (MQ=255) cAGCTTCAATTCTTTCGCGACGTTGTCATTCCACGCACTTAAATTGCCGAGATCCGGATACACAGTGAACCACGGCGATTTGATAAGGTCATCCCATTTTTTCCAGCGACTGATGGAGCTCATAAATTGGGTATCCATAATTTCTACCGCAATGGTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTc > 1:96531/1‑249 (MQ=255) 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tGGTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGC‑TTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATgg > 1:770642/1‑245 (MQ=255) ggTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAAc < 1:858942/109‑1 (MQ=255) ggTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAacgac > 1:410726/1‑215 (MQ=255) ggTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATGGTAACg > 1:158550/1‑250 (MQ=255) 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aTTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATGGTAACGCCGGTTTTGATAATGGCTTTCAcc < 1:370219/251‑1 (MQ=255) tCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATGGTAACGCCGGTTTTGATAATGGCTTTCACCaa > 1:232459/1‑251 (MQ=255) ccACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAg > 1:835900/1‑210 (MQ=255) 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ttGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGaa > 1:116899/1‑202 (MQ=255) ttGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATGGTAACGCCGGTTTTGATAATGGCTTTCACCAACTGAATg < 1:75179/247‑1 (MQ=255) ttGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATGGTAACGCCGGTTTTGATAATGGCTTTCACCAACTGAATGCGtt > 1:42112/1‑251 (MQ=255) tcttGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTTGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCg < 1:896245/156‑1 (MQ=255) 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TGGCGGAGATTTTGTCGATGCCCAGCTTCAATTCTTTCGCGACGTTGTCATTCCACGCACTTAAATTGCCGAGATCCGGATACACAGTGAACCACGGCGATTTGATAAGGTCATCCCATTTTTTCCAGCGACTGATGGAGCTCATAAATTGGGTATCCATAATTTCTACCGCAATGGTCACTTGATTACTTGCCGCCAATTCCACCGCCCATTGCAAGCCTTCTTGGAAGCGCTGAATAGTGCCTTCGTCCTGCTCTTCGTAATACACGTCATAACCCGCCAACTGAATGGTGCGAATACCTAAATCGACGGCTAATTTAACGGCTTTTTCCATGATTTCATAAGCTTTTGCGCGGGTTGCTTCGTCACGGCTGCCGAAAGGAAAACGACGATGCCCGGAAAGACACATAGAAGGAATGGTAACGCCGGTTTTGATAATGGCTTTCACCAACTGAATGCGTTCTTTTTCGCTCCAATCCA > 1/1564740‑1565219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |