| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,557,281 | G→A | intergenic (‑112653/‑84483) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,557,281 | 0 | G | A | 98.4% | 160.1 / ‑5.7 | 61 | intergenic (‑112653/‑84483) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (28/32); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTCCACCGCAGACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTGGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCCGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGCCAATGCGGATCTCGGCGTATTGCCTGCGGAAA > 1/1557034‑1557519 | ttCCACCGCAGACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCCGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGtt > 1:70370/1‑251 (MQ=255)ttCCACCGCAGACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGtt > 1:751412/1‑251 (MQ=255)ttCCACCGCAGACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCCAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGtt < 1:454139/251‑1 (MQ=255) ccGCAGACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCt < 1:272886/251‑1 (MQ=255) gACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTa > 1:416973/1‑251 (MQ=255) gACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTa > 1:136169/1‑251 (MQ=255) aaTTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCa < 1:285559/251‑1 (MQ=255) aaTTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCa < 1:80013/251‑1 (MQ=255) tgtgCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAgg < 1:520572/251‑1 (MQ=255) tgtgCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAgg < 1:403644/251‑1 (MQ=255) gtgCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGt > 1:154172/1‑251 (MQ=255) gtgCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGt > 1:418173/1‑251 (MQ=255) tCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCAt > 1:753921/1‑251 (MQ=255) aaGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGc < 1:636595/251‑1 (MQ=255) cAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCAt < 1:51930/243‑1 (MQ=255) aGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAag < 1:638243/224‑1 (MQ=255) ttGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGac < 1:517222/251‑1 (MQ=255) tttGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTg < 1:659967/251‑1 (MQ=255) ggCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGaag > 1:456589/1‑251 (MQ=255) ggCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGaag > 1:235391/1‑251 (MQ=255) ggCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGaag > 1:266522/1‑251 (MQ=255) cATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAag > 1:641664/1‑201 (MQ=255) atatAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTAt < 1:547961/240‑1 (MQ=255) ataAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATc < 1:686488/206‑1 (MQ=255) ataAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATgg < 1:676987/213‑1 (MQ=255) gCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATcac > 1:550328/1‑203 (MQ=255) aaaTATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTa > 1:265695/1‑179 (MQ=255) aaTATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCAt > 1:486066/1‑205 (MQ=255) aGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGc < 1:498502/250‑1 (MQ=255) aTTTTATCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATATATTCGTTTACCAGTGCTCTAATCTGGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGCTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAAc > 1:253198/1‑250 (MQ=255) aTTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAAc > 1:744408/1‑250 (MQ=255) cGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACg < 1:308589/249‑1 (MQ=255) tCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCaataat < 1:387628/251‑1 (MQ=255) aTAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATcac < 1:406553/153‑1 (MQ=255) aaaaTGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAAt < 1:72910/251‑1 (MQ=255) aTGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGc < 1:542673/212‑1 (MQ=255) gTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATcaca < 1:79393/145‑1 (MQ=255) gTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGt > 1:618221/1‑250 (MQ=255) tCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATcac > 1:381136/1‑137 (MQ=255) ttttGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGcc < 1:536857/251‑1 (MQ=255) gCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGa > 1:318066/1‑251 (MQ=255) cTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCcac < 1:180105/235‑1 (MQ=255) ttATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGt < 1:97803/142‑1 (MQ=255) ttATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGcac > 1:774731/1‑179 (MQ=255) ttATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGc > 1:636525/1‑249 (MQ=255) ttATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGc > 1:851805/1‑249 (MQ=255) tCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGtt < 1:573409/251‑1 (MQ=255) cTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTa < 1:427132/251‑1 (MQ=255) aGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATcac < 1:882952/99‑1 (MQ=255) gTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAAt > 1:807258/1‑199 (MQ=255) gTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTAttt < 1:707595/250‑1 (MQ=255) tCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGcc > 1:520833/1‑219 (MQ=255) ccGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGt > 1:882907/1‑236 (MQ=255) ttGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGcc < 1:667668/251‑1 (MQ=255) gTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCaataat < 1:702587/159‑1 (MQ=255) tCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGcc < 1:501391/238‑1 (MQ=255) gTTTACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGCCAATGCGGATCTCGGCGTATTGc > 1:645601/1‑250 (MQ=255) tACCAGTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGCCAATGCGGATCTCGGCGTATTGCCTg > 1:285671/1‑250 (MQ=255) gTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTg > 1:28178/1‑199 (MQ=255) gTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGCCAATGc < 1:382412/225‑1 (MQ=255) gTGCTAGAATCTAGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCTGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGCCAATGCGGATCTCGGCGTATTGCCTGCGGaaa > 1:472293/1‑251 (MQ=255) | TTCCACCGCAGACAAATTCGTCTGTGCGGGAGAGGCATCGGAAAGCAGGTAGAATTGCGCATTTTTTGGCATATAAAGCCCTAAATATGAAAAATGAGTCGCAAGATTTTAGCGGAAATCAGCTCAAATAGAAAATGTTAATTTCCGAAACGTTTTGCAAGCGAACCGCACTTTATGATCTAGGTCACAAAACCGTTTTTCTGTTTGTAATTTCGGTTCATAGATTCGTTTACCAGTGCTAGAATCTGGTTAATCTTGTTAATCATTAAGAGGTAATCACAATGGCATTTCGCATTGAAAAAGACACTATGGGTGAAGTTCAAGTTCCGGCAGACAAATATTGGGCTGCACAAACCGAACGTTCCCGCAATAATTTTAAAATCGGTCCCGCGGCATCTATGCCACATGAAATTATCGAAGCCTTTGGTTATTTGAAAAAAGCGGCGGCGTTTGCCAATGCGGATCTCGGCGTATTGCCTGCGGAAA > 1/1557034‑1557519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |