| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,555,925 | G→C | intergenic (‑111297/‑85839) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,555,925 | 0 | G | C | 100.0% | 98.1 / NA | 35 | intergenic (‑111297/‑85839) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (17/18); total (17/18) | |||||||||||
CACTTTATGGAATTATTTTCTAACAGTATGAGAAAGCAAAATTCTTGAAACTTCTTCTAATTTTCTATTATTCTCTTCAATCGCTGCGTTCTTATCATCTTTAAAATAAAAGATAACTAAAGGTAAATTAACCTGTTGACAAGCATATTGTTTGCGAATATCTCGATAAGCAGGATTTTCTATATTATGTCCGTAACCATTATATTCAATTAGTACTACAGGATAACCCAAACAATCTAGAATAATAAAATCAGCTCTTAATGAATTTATTGCCAAAAAAGCATTTTTCTCATTTTGAGAAGCTGATTTATAAGGTGTCTTTGTATTTATAATGCCACCAAGTCCAACTTGAGAGAATAGTCTAAAATTTTTTCCCTTATACTTTTCATCATTCAATAGATCTGTTAGTGATTTGAATATATTAAACTCACTTTTATTCATTATTGGTA > 1/1555686‑1556134 | cACTTTATGGAATTATTTTCTAACAGTATGAGAAAGCAAAATTCTTGAAACTTCTTCTAATTTTCTATTATTCTCTTCAATCGCTGCGTTCTTATCATCTTTAAAATAAAAGATAACTAAAGGTAAATTAACCTGTTGACAAGCATATTGTTTGCGAATATCTCGATAAGCAGGATTTTCTATATTATGTCCGTAACCATTATATTCAATTAGTACTACAGGATAACCCAAACAATCTACAATAATaaaa < 1:305873/250‑1 (MQ=255) ttCTATTATTCTCTTCAATCGCTGCGTTCTTATCATCTTTAAAATAAAAGATAACTAAAGGTAAATTAACCTGTTGACAAGCATATTGTTTGCGAATATCTCGATAAGCAGGATTTTCTATATTATGTCCGTAACCATTATATTCAATTAGTACTACAGGATAACCCAAACAATCTACAATAATAAAATCAGCTCTTAATGAATTTATTGCCAAAAAAGCATTTTTCTCATTTTGAGAAGCTGATTTATaa 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |