| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 333,266 | C→T | intergenic (‑65906/+11339) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 333,266 | 0 | C | T | 100.0% | 216.3 / NA | 80 | intergenic (‑65906/+11339) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (43/37); total (43/37) | |||||||||||
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aCGCTTGCTTCGGTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAGGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAatttat > 1:316418/1‑245 (MQ=255) cttCGGTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAatat < 1:896960/250‑1 (MQ=255) cttCGGTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAatat < 1:793472/250‑1 (MQ=255) gTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACAt > 1:431630/1‑251 (MQ=255) tATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATc > 1:752763/1‑187 (MQ=255) tATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAatttattt < 1:845288/233‑1 (MQ=255) tATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACa > 1:172766/1‑248 (MQ=255) cTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCa < 1:285473/251‑1 (MQ=255) cGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGc < 1:828319/251‑1 (MQ=255) tCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTccc < 1:700153/185‑1 (MQ=255) | TGCAGCTTCAATCCAAGCATTCGGATTAGAGATAAACTTATCCCAGTTACATTGAAGCATATATGAATTAGAACAACTATTCCTTAGTTTATATGTAGTATATGGTGTATGCAGGTTATTCAAGTTTCTTTGAATAATATCAAAATAAAAGCCATATGAATTTACGTAATCATAATAACCATATCTATCAGGTAGAACGACCAATAAAATTGCATTACGCTTGCTTCGGTTATCTGGACGTCGCTCACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGC > 1/333021‑333509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |