| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,528,708 | A→C | intergenic (‑84080/‑113056) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,528,708 | 0 | A | C | 100.0% | 157.5 / NA | 59 | intergenic (‑84080/‑113056) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (33/26); total (33/26) | |||||||||||
CCTTGGTGGCACCGATGATGAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGACTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAGGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCATGAAATGG > 1/1528485‑1528954 | ccTTGGTGGCACCGATGATGAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACaa < 1:321800/251‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCACCGATGATGAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAg < 1:700995/251‑1 (MQ=255) cACCGATGATGAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCt < 1:793681/250‑1 (MQ=255) cGATGATGAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGAt < 1:377840/251‑1 (MQ=255) atgatgAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGt < 1:320788/232‑1 (MQ=255) atgaAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTaagc < 1:82360/251‑4 (MQ=255) ttAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCa < 1:158945/249‑1 (MQ=255) aaaCATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTcccc < 1:815007/251‑1 (MQ=255) ctctctCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTgggg < 1:486185/251‑1 (MQ=255) ctctctCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTgggg < 1:73805/251‑1 (MQ=255) aTCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGAGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGa > 1:222938/1‑251 (MQ=255) cccAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTgggg > 1:645570/1‑237 (MQ=255) cccAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAg > 1:595799/1‑251 (MQ=255) taataGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTg > 1:283483/1‑251 (MQ=255) cTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAg < 1:768727/233‑1 (MQ=255) tttAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAAc < 1:363094/251‑1 (MQ=255) aCATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTa < 1:714829/251‑1 (MQ=255) aaGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCg < 1:840011/251‑1 (MQ=255) aaGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCg < 1:606192/251‑1 (MQ=255) gggCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCg < 1:608971/238‑1 (MQ=255) gggTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGt < 1:836477/138‑1 (MQ=255) gggTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGAttt > 1:727356/1‑250 (MQ=255) gggTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGAttt > 1:130898/1‑250 (MQ=255) gggTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGAttt > 1:608764/1‑250 (MQ=255) ggCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTAc > 1:154175/1‑250 (MQ=255) gACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACtt > 1:840142/1‑251 (MQ=255) ggATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCa < 1:702686/212‑1 (MQ=255) aTACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAg > 1:265619/1‑179 (MQ=255) ccATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGCTAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAgg > 1:790681/1‑251 (MQ=255) ccATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAgg > 1:886493/1‑251 (MQ=255) tcatAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCt > 1:434780/1‑109 (MQ=255) tcatAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCa < 1:316176/125‑1 (MQ=255) tcatAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGAt < 1:377211/206‑1 (MQ=255) tcatAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAggggg > 1:837287/1‑251 (MQ=255) cGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCAt > 1:361436/1‑250 (MQ=255) cccTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTTCCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGc < 1:520790/224‑1 (MQ=255) cTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTcccc < 1:127820/119‑1 (MQ=255) tttCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAgc < 1:386753/251‑1 (MQ=255) cTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTgggg < 1:144874/114‑1 (MQ=255) gAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTAtttt > 1:833830/1‑152 (MQ=255) gAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGAttt > 1:785989/1‑251 (MQ=255) atatGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTcccc < 1:738241/99‑1 (MQ=255) gTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAggg > 1:683225/1‑110 (MQ=255) gTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTa > 1:87796/1‑251 (MQ=255) gTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTa > 1:250415/1‑251 (MQ=255) tCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAg > 1:647859/1‑116 (MQ=255) tCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAgg > 1:297824/1‑251 (MQ=255) cTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGt < 1:790133/174‑1 (MQ=255) cTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATg > 1:309229/1‑191 (MQ=255) cTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTg > 1:718848/1‑219 (MQ=255) cTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGaaa > 1:605163/1‑251 (MQ=255) cTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGaaa > 1:690921/1‑251 (MQ=255) aGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAAtttt > 1:198901/1‑251 (MQ=255) atCTCCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGc > 1:471371/1‑250 (MQ=255) ctcCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTaagc > 1:22727/1‑53 (MQ=255) ctcCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATaaaa > 1:278093/1‑106 (MQ=255) ctcCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCAt > 1:104004/1‑251 (MQ=255) ctcCTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCAt > 1:790834/1‑251 (MQ=255) ccTAGATAGCCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCATGa > 1:282550/1‑251 (MQ=255) agatagcCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATc < 1:622593/192‑1 (MQ=255) agatagcCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCATGAAAt > 1:870610/1‑251 (MQ=255) atagcCTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAAGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCATGAAATgg < 1:151525/251‑1 (MQ=255) | CCTTGGTGGCACCGATGATGAAGCAGTTAAAAACATGCTCTCTCCCGATCTCCCAATAATAGGGCTGCCCTTTAACGGCAACATAAGGCTCGGGTAAGGGCTCGCGCGGGGTGGCGCAGGCGGTGACTAGGATACAGCAAAGACTCACCATCATAAAACGCCCTTTCCCGATCACTTGAATAATATGGTTCACTATAGTCATTTGTTATTATCTCCTAGATAGACTTGGTGTTTTTTGCCTAGGGTAACAAGTTACCCTAGATTAGGCATAGTCATTCCCCTTTGGGGAATTTAGGGAACAGAAGTGCAGTCATAAAAAACAGTATTTTTAAGCGTTTTCAACGATAGAAAACGATTTCAAAATGTACCGCACTTTTTTGATGCTCCGACAAAACAGGGGGCCCCCATCTGAGCCGCCTGAGCGATTTGCAATTTTTAGGAAATTTTCGCCTGTTTGAGCCATGAAATGG > 1/1528485‑1528954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |