| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,514,689 | G→C | intergenic (‑70061/‑127075) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,514,689 | 0 | G | C | 100.0% | 209.7 / NA | 75 | intergenic (‑70061/‑127075) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (44/31); total (44/31) | |||||||||||
ATTGCAGGTGAATAACCTCGGTTCGGGCGTGATCATGTCAAAAGACGGTTATATTCTGACGAACAAACACGTTATTCAAAATGCCGATCAAATTGTAGTAGCGTTGCAAAACGGGCATATTTTTGATGCGGCGCTCATTGGTTCCGATTCTTTAACGGATTTGGCAGTATTAAAAATTAAAGCGGATAATTTATCCACGATTCCGCAAAATCTCAGCCGTCCGGTGCATGTGGGAGATGTGGGGCTGGCAATCGGCAATCCGTATAACCTGGGGCAAAGCGTGTCACAGGGGATTATCAGTGCGGTGGGACGTAGCGCGGTGGGTGAGGCGCTCGGGCGACAAAACTTCATTCAAACAGACGCCTCTATTAACCGTGGGAATTCCGGTGGCGCGTTGATTAATTCCGCCGGCGAACTGGTGGGCATCAGCACGTTGAGTATCGGTAAAACCTCCAATGAAATTGCCGAAGGTCTTAATTTTGCCAT > 1/1514447‑1514932 | aTTGCAGGTGAATAACCTCGGTTCGGGCGTGATCATGTCAAAAGACGGTTATATTCTGACGAACAAACACGTTATTCAAAATGCCGATCAAATTGTAGTAGCGTTGCAAAACGGGCATATTTTTGATGCGGCGCTCATTGGTTCCGATTCTTTAACGGATTTGGCAGTATTAAAAATTAAAGCGGATAATTTATCCACGATTCCGCAAAATCTCAGCCGTCCGGTGCATGTGGGAGATGTGGCGCTggcaa > 1:366068/1‑251 (MQ=255) 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cATGTGGGAGATGTGGCGCTGGCAATCGGCAATCCGTATAACCTGGGGCAAAGCGTGTCACAGGGGATTATCAGTGCGGTGGGACGTAGCGCGGTGGGTGAGGCGCTCGGGCGACAAAACTTCATTCAAACAGACGCCTCTATTAACCGTGGGAATTCCGGTGGCGCGTTGATTAATTCCGCCGGCGAACTGGTGGGCATCAGCACGTTGAGTATCGGTAAAACCTCCAATGAAATTGCCGAAGGTCTTaa > 1:290945/1‑251 (MQ=255) aTGTGGGAGATGTGGCGCTGGCAATCGGCAATCCGTATAACCTGGGGCAAAGCGTGTCACAGGGGATTATCAGTGCGGTGGGACGTAGCGCGGTGGGTGAGGCGCTCGGGCGACAAAACTTCATTCAAACAGACGCCTCTATTAACCGTGGGAATTCCGGTGGCGCGTTGATTAATTCCGCCGGCGAACTGGTGGGCATCAGCACGTTGAGTATCGGTAAAACCTCCAATGAAATTGCCGAAGGTCTTAAt < 1:470662/251‑1 (MQ=255) tgtgGGAGATGTGGCGCTGGCAATCGGCAATCCGTATAACCTGGGGCAAAGCGTGTCACAGGGGATTATCAGTGCGGTGGGACGTAGCGCGGTGGGTGAGGCGCTCGGGCGACAAAACTTCATTCAAACAGACGCCTCTATTAACCGTGGGAATTCCGGTGGCGCGTTGATTAATTCCGCCGGCGAACTGGTGGGCATCAGCACGTTGAGTATCGGTAAAACCTCCAATGAAATTGCCGAAGGTCTTAAtt < 1:271822/251‑1 (MQ=255) 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ATTGCAGGTGAATAACCTCGGTTCGGGCGTGATCATGTCAAAAGACGGTTATATTCTGACGAACAAACACGTTATTCAAAATGCCGATCAAATTGTAGTAGCGTTGCAAAACGGGCATATTTTTGATGCGGCGCTCATTGGTTCCGATTCTTTAACGGATTTGGCAGTATTAAAAATTAAAGCGGATAATTTATCCACGATTCCGCAAAATCTCAGCCGTCCGGTGCATGTGGGAGATGTGGGGCTGGCAATCGGCAATCCGTATAACCTGGGGCAAAGCGTGTCACAGGGGATTATCAGTGCGGTGGGACGTAGCGCGGTGGGTGAGGCGCTCGGGCGACAAAACTTCATTCAAACAGACGCCTCTATTAACCGTGGGAATTCCGGTGGCGCGTTGATTAATTCCGCCGGCGAACTGGTGGGCATCAGCACGTTGAGTATCGGTAAAACCTCCAATGAAATTGCCGAAGGTCTTAATTTTGCCAT > 1/1514447‑1514932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |