| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,508,549 | C→A | intergenic (‑63921/‑133215) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,508,549 | 0 | C | A | 100.0% | 244.1 / NA | 90 | intergenic (‑63921/‑133215) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (45/45); total (45/45) | |||||||||||
ATATAATTTTTAAACAAAAGAGTAAAGATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATACCCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAAGAGTGAAAATCATTTTATGAAAAAATTA > 1/1508304‑1508774 | gtataATTTTTAAACAAAAGAGTAAAGATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGaa > 1:779848/2‑251 (MQ=255) aaGAGTAAAGATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTAc < 1:504510/251‑1 (MQ=255) aaGAGTAAAGATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTAc < 1:856775/251‑1 (MQ=255) agTAAAGATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTAcc < 1:607673/249‑1 (MQ=255) gATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCg < 1:390541/223‑1 (MQ=255) gATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTAc < 1:769599/242‑1 (MQ=255) gATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCgg > 1:797875/1‑245 (MQ=255) tAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTAc < 1:777200/250‑1 (MQ=255) aaTGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACAt < 1:321617/251‑1 (MQ=255) aaTGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACAt < 1:155327/251‑1 (MQ=255) aaTGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACAt < 1:738930/251‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCg < 1:799511/207‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTa < 1:365348/213‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACAt < 1:628953/223‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATc < 1:854973/239‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTAc < 1:116614/242‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACAt < 1:254770/244‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATacc > 1:834615/1‑247 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATacc < 1:779144/247‑1 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATAccacca > 1:119539/1‑251 (MQ=255) atatAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATAccacca > 1:466616/1‑251 (MQ=255) ataGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTAc > 1:174379/1‑219 (MQ=255) ataGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCgg < 1:560840/227‑1 (MQ=255) ataGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATg > 1:727564/1‑251 (MQ=255) agaagaTTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATggg > 1:343373/1‑251 (MQ=255) aagaTTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATggg < 1:87684/249‑1 (MQ=255) aagaTTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGa < 1:151960/250‑1 (MQ=255) aaaaGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATaaaa < 1:50624/251‑1 (MQ=255) gATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACAt > 1:25092/1‑225 (MQ=255) gATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATaa > 1:517101/1‑251 (MQ=255) aTAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCcaca > 1:587482/1‑217 (MQ=255) aaTTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGAt < 1:691599/251‑1 (MQ=255) cTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTcc > 1:107789/1‑250 (MQ=255) cTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTcc > 1:497291/1‑250 (MQ=255) ccAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGcc < 1:277353/251‑1 (MQ=255) cAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCa < 1:197477/251‑1 (MQ=255) gTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAAc < 1:80429/172‑1 (MQ=255) gTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCt < 1:389847/180‑1 (MQ=255) gTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACAt < 1:486796/184‑1 (MQ=255) gTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTAcc > 1:784778/1‑188 (MQ=255) gTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACAt > 1:399645/1‑205 (MQ=255) aTGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGc > 1:555911/1‑244 (MQ=255) gAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACg > 1:426440/1‑251 (MQ=255) aaaGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGAcc > 1:658097/1‑236 (MQ=255) aCATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGAcc > 1:715277/1‑229 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACAt > 1:494292/1‑138 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATacc > 1:114635/1‑162 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGcc < 1:880709/199‑1 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGc < 1:288108/211‑1 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAAt > 1:497041/1‑250 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAAt > 1:512650/1‑250 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAAt > 1:511228/1‑250 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAAt > 1:244110/1‑250 (MQ=255) gAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAAt > 1:253237/1‑250 (MQ=255) atatAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGa > 1:267233/1‑251 (MQ=255) gTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGc > 1:7713/1‑203 (MQ=255) gTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATga > 1:457141/1‑251 (MQ=255) cAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTGCATTACCGGTg < 1:514162/133‑1 (MQ=255) cAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATaa > 1:730488/1‑251 (MQ=255) gATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATg < 1:555365/240‑1 (MQ=255) gATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTa > 1:637920/1‑251 (MQ=255) aTTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGtt < 1:309872/248‑1 (MQ=255) gTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTaaaaaa > 1:460199/1‑211 (MQ=255) gTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGaa > 1:471432/1‑137 (MQ=255) gTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAAc > 1:433665/1‑194 (MQ=255) cATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGaaa < 1:520971/212‑1 (MQ=255) cATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGtt < 1:607630/230‑1 (MQ=255) cATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATaa > 1:683600/1‑251 (MQ=255) tGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTAcc < 1:103417/103‑1 (MQ=255) tGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAg < 1:103722/251‑1 (MQ=255) gAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATgaga > 1:666158/1‑221 (MQ=255) aaTGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGAc < 1:376017/251‑1 (MQ=255) ttttttAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTAttg < 1:273732/251‑1 (MQ=255) aCCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACAACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGt > 1:451872/1‑206 (MQ=255) cAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAAt < 1:693994/251‑1 (MQ=255) aCAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAag < 1:596509/251‑1 (MQ=255) cAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGcc < 1:459415/175‑1 (MQ=255) aGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAAc < 1:332505/160‑1 (MQ=255) aCTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAAGAGTGaaaa > 1:253147/1‑251 (MQ=255) cTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGc > 1:266686/1‑58 (MQ=255) cTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGt > 1:520684/1‑202 (MQ=255) cTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGAc > 1:557888/1‑217 (MQ=255) ttGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAAGAGTGAAAATCATTTTATg > 1:505999/1‑251 (MQ=255) gCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTATATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAAc < 1:432028/198‑1 (MQ=255) gagGATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAAc > 1:3831/1‑193 (MQ=255) ggATAATACTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAAGAGTGAAAATCATTTTATGAAAAAATTa > 1:45843/1‑251 (MQ=255) taCTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGAt < 1:268586/89‑1 (MQ=255) taCTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGAcc > 1:87030/1‑120 (MQ=255) taCTTACCCAAATTACATAACCGAAACTACGGGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAAttt < 1:426776/201‑1 (MQ=255) aaaTTACATAACCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCTCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAag < 1:430793/209‑1 (MQ=255) | ATATAATTTTTAAACAAAAGAGTAAAGATAAAAGTAATGCCAATATAGAAGATTGCGAAAAGATAATTAACTTTTCCAACTGTCAGGATGTAACCAAGAATAACCGGAATAAAGAAGACATTACACAGAATATAAGTCCGCAACAGATTCATGCAGTAATCGGTCATGAATGGTCTGGCTTTTTTTAACCCAAACAAGCCAACTAAATAAGTTGCCAAGAGGATAATACTTACCCAAATTACATACCCGAAACTACGTGCTACATTACCGGTGCCCACATCTACATACCACCATGGGAAGCCATAAAAATAAGATTGTCCCCAGCCATAGCCGTAAGCTACTGACCAACCCAAAACGACTAAAAAAGCCATAGAAATCGAAGATGAGATAAGTTTACTTAAGGTTTTTAACATAAAGACTTTAATTTATTGTTGGTAAAATAAGAGTGAAAATCATTTTATGAAAAAATTA > 1/1508304‑1508774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |