| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,507,829 | C→T | intergenic (‑63201/‑133935) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,507,829 | 0 | C | T | 100.0% | 242.1 / NA | 89 | intergenic (‑63201/‑133935) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (47/42); total (47/42) | |||||||||||
TTTTGCTAATGCTGTAGTCCGCGGTTTACAAGGTGAAACCGTCGTAGAATGCAGCTATGTGGAAGGCGACGGCAAATACGCCCGCTTCTTCGCACAACCGGTTCGCTTCGGCAAGGAAGGTGTGGAAGAAATTCTACCAATCGGTAAACTCAGCGCCTTGGAACAACAGGCTTTAGAAACCATGTTACCGACATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTCGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGACACGACATAAAAAATTAATATTCATTTTATAAAGATAAAAACTGTCATTAGT > 1/1507583‑1508071 | ttttGCTAATGCTGTAGTCCGCGGTTTACAAGGTGAAACCGTCGTAGAATGCAGCTATGTGGAAGGCGACGGCAAATACGCCCGCTTCTTCGCACAACCGGTTCGCTTCGGCAAGGAAGGTGTGGAAGAAATCCTACCAATCGGTAAACTCAGCGCCTTGGAACAACAGGCTTTAGAAACCATGTTACCGACATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGgc < 1:358538/251‑1 (MQ=255) 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aCATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGacac < 1:589965/250‑1 (MQ=255) aCATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGacac < 1:823277/250‑1 (MQ=255) cATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTAt > 1:749385/1‑201 (MQ=255) cATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTc > 1:419979/1‑208 (MQ=255) ttGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGACACGACa < 1:638498/251‑1 (MQ=255) tGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAAcc > 1:466042/1‑236 (MQ=255) gCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATgag < 1:838140/170‑1 (MQ=255) gTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGc > 1:597839/1‑217 (MQ=255) tGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAg > 1:875733/1‑215 (MQ=255) gATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTc > 1:322555/1‑197 (MQ=255) atatTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGACACGACATaaaaaa < 1:322402/248‑1 (MQ=255) tatTGAATTAGGTGGGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATaaaa < 1:183339/58‑1 (MQ=255) ggTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATgag > 1:749123/1‑151 (MQ=255) ggTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTAtt > 1:699300/1‑212 (MQ=255) aaGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTAt > 1:598774/1‑172 (MQ=255) aaGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAAcc > 1:193519/1‑210 (MQ=255) gTTTATTAATCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTAtgtg > 1:116138/1‑200 (MQ=255) 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1:766748/1‑135 (MQ=255) tCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTAt < 1:374168/194‑1 (MQ=255) tCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAAc > 1:513332/1‑198 (MQ=255) tCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGacac > 1:730594/1‑209 (MQ=255) tCCATAGGCTGACCTTGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGaca < 1:224399/208‑1 (MQ=255) 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TTTTGCTAATGCTGTAGTCCGCGGTTTACAAGGTGAAACCGTCGTAGAATGCAGCTATGTGGAAGGCGACGGCAAATACGCCCGCTTCTTCGCACAACCGGTTCGCTTCGGCAAGGAAGGTGTGGAAGAAATTCTACCAATCGGTAAACTCAGCGCCTTGGAACAACAGGCTTTAGAAACCATGTTACCGACATTGCGTGCAGATATTGAATTAGGTGAGAAGTTTATTAATCCATAGGCTGACCTCGGGCATAGCATAAAAAGTGCGGTGAATATTTTCTGCGTTTTTATTGCTTTCGTTCCCTATCGAGAAAATCCCCGCTTGAACGGGGATTTTCTCTATCTGGGAATACGTAGAATATGAGAAATGGCTAAAATGCACAAGCTACTATTTTAGTCAGGTTGTATTAAAGCATTATGTGTATTAACCACTCTGACACGACATAAAAAATTAATATTCATTTTATAAAGATAAAAACTGTCATTAGT > 1/1507583‑1508071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |