| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,490,751 | A→G | intergenic (‑46123/‑151013) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,490,751 | 0 | A | G | 100.0% | 222.7 / NA | 82 | intergenic (‑46123/‑151013) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (45/37); total (45/37) | |||||||||||
GTTTTGAATTTATTGAGAAAACCAATCCGGATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGGAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCACCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTGATTTTAGTAGGCGCCACAC > 1/1490506‑1490993 | gTTTTGAATTTATTGAGAAAACCAATCCGGATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGaa > 1:10184/1‑251 (MQ=255) tttGAATTTATTGAGAAAACCAATCCGGATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATc < 1:53502/251‑1 (MQ=255) aaTCCGGATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCg > 1:699845/1‑251 (MQ=255) cGGATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGgag < 1:739182/251‑1 (MQ=255) gATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACgg > 1:200817/1‑233 (MQ=255) gATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGgagag > 1:280112/1‑251 (MQ=255) gATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGgagag > 1:665937/1‑251 (MQ=255) tGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAAc < 1:575975/251‑1 (MQ=255) gttgttTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAAcc < 1:108367/250‑1 (MQ=255) gtttgtGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCtttt > 1:113858/1‑251 (MQ=255) tgtTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATg < 1:210239/251‑1 (MQ=255) tCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCGAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc < 1:528420/251‑1 (MQ=255) tCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc < 1:322797/251‑1 (MQ=255) tCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc < 1:174022/251‑1 (MQ=255) tCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc < 1:817122/251‑1 (MQ=255) cATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc < 1:403345/248‑1 (MQ=255) cATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCAt > 1:247661/1‑251 (MQ=255) ttCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGc > 1:538711/1‑250 (MQ=255) ccGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGa > 1:92208/1‑251 (MQ=255) aTCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACAtt > 1:342806/1‑251 (MQ=255) ggAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc > 1:345499/1‑230 (MQ=255) gAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAcc < 1:312652/230‑1 (MQ=255) gAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCAccc < 1:125331/249‑1 (MQ=255) gAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCAcc > 1:692719/1‑248 (MQ=255) gAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCAcc > 1:71438/1‑248 (MQ=255) ccAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc > 1:418402/1‑216 (MQ=255) aagTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAGATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTc < 1:743825/250‑1 (MQ=255) gTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCtt > 1:175425/1‑251 (MQ=255) aTAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCtt < 1:787319/250‑1 (MQ=255) aattaattCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTc < 1:473275/250‑1 (MQ=255) aattaattCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCCTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTc > 1:457836/1‑250 (MQ=255) taattCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCAccc > 1:394657/1‑212 (MQ=255) tCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGgca < 1:72747/250‑1 (MQ=255) tCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGgc > 1:349993/1‑249 (MQ=255) cacCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCAt < 1:168034/251‑1 (MQ=255) cAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTAc < 1:562296/251‑1 (MQ=255) gCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTc > 1:236196/1‑230 (MQ=255) gCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGt > 1:227858/1‑250 (MQ=255) ccTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGCTTTCTCCTGCGGgag > 1:168156/1‑152 (MQ=255) gAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGgtg < 1:382576/250‑1 (MQ=255) aCGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCgg < 1:464684/251‑1 (MQ=255) cGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAcc < 1:146199/165‑1 (MQ=255) atCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCAt > 1:35515/1‑251 (MQ=255) tCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAAt > 1:244206/1‑108 (MQ=255) gtgtATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAAc < 1:752105/179‑1 (MQ=255) gtATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAAc > 1:3648/1‑162 (MQ=255) tATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTg > 1:794064/1‑123 (MQ=255) tATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc > 1:109845/1‑151 (MQ=255) tATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGca > 1:440665/1‑251 (MQ=255) tATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGca > 1:298556/1‑251 (MQ=255) aTTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCgg > 1:595535/1‑228 (MQ=255) aTTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGca > 1:577286/1‑250 (MQ=255) tttAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTAc < 1:100570/202‑1 (MQ=255) gcCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTAc > 1:895200/1‑250 (MQ=255) ccTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGACCCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGgcagc > 1:208647/1‑205 (MQ=255) ctctTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAc < 1:293910/137‑1 (MQ=255) ctctTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCa > 1:91835/1‑251 (MQ=255) ctTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGt < 1:485537/129‑1 (MQ=255) aCCTTGCGCCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCgg > 1:868614/1‑251 (MQ=255) gcgcCGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATAcc > 1:389975/1‑128 (MQ=255) cGGGTGGTGCGAAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGc < 1:811619/251‑1 (MQ=255) ttAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGc < 1:597850/251‑1 (MQ=255) ttAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGc < 1:116605/251‑1 (MQ=255) gATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCg > 1:79349/1‑251 (MQ=255) gAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAAc > 1:38941/1‑75 (MQ=255) gAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCGCCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCg < 1:288808/166‑1 (MQ=255) gAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTg < 1:822404/188‑1 (MQ=255) cATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCAc < 1:9372/143‑1 (MQ=255) cATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCGCAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGc < 1:726860/223‑1 (MQ=255) cATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAAccgccg > 1:281957/1‑250 (MQ=255) cATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAAccgccg > 1:389101/1‑250 (MQ=255) cATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAAccgccg > 1:778182/1‑250 (MQ=255) cATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAAccgccg > 1:501467/1‑250 (MQ=255) aaaGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTg < 1:464758/251‑1 (MQ=255) gccTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTtctc < 1:127333/122‑1 (MQ=255) gccTTTGAGAAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTGATTTta > 1:271001/1‑251 (MQ=255) gagaAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTAc > 1:730588/1‑142 (MQ=255) gagaAAAAATAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTGATTTTAGTAgg > 1:853420/1‑250 (MQ=255) aaaaaaTAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTGATTTTAGTAGGCGcc < 1:619584/251‑1 (MQ=255) aaaaTAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGc < 1:177778/210‑1 (MQ=255) aaaTAATCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCCGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGCGATTTTAGTAGGCGCcaca > 1:779916/1‑251 (MQ=255) aataatCCGCCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTGATTTTAGTAGGCGCCacac < 1:187445/251‑1 (MQ=255) | GTTTTGAATTTATTGAGAAAACCAATCCGGATTGGTTGTTTGTGTTAGATCGCATTTCCGCTATCGGGCAGGAAGGGAAAGGCGCCAAAGAAGTATTGGATAACGAATTAATTCGTCACACCAAAGCCTGGAAAAACGGCAATATCGTGTATTTAAGCAGCGCCTCTTACCTTGCGCCGGGTGGTGCGGAACAATTAAAAATGGATTTGAATAACATCAAAGCCGCCTTTGAGAAAAAATAATCCACCGAATCTTTTAACGGTTTTCTCCTGCGGGAGAGAACCTTTTTTATGTTAATACCATGCCGAACATTTTCACCCTGAACCGAATTAATTTTGTCCTTCTCCTTTTACTCACCGTGGGCAGCATTACCGTCGGTGTTGCGGATTTTCATTGGGCACAATTTTTTACCCAACCGGAGCAAATGCAGGTATTGCTTATCAGCCGCTTGCCGAGAACCGCCGCCGTGATTTTAGTAGGCGCCACAC > 1/1490506‑1490993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |