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ccTTTGTATTCAACGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCca > 1:234475/1‑250 (MQ=255) ccTTTGTATTCAACGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCca > 1:429421/1‑250 (MQ=255) tttGTATTCAACGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCgg < 1:472740/189‑1 (MQ=255) gTATTCAACGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGt > 1:251608/1‑251 (MQ=255) tATTCAACGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGt < 1:187421/250‑1 (MQ=255) aCGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTg < 1:467149/251‑1 (MQ=255) gTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAACCAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTAt > 1:436974/1‑246 (MQ=255) ttttGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTgggc < 1:234837/250‑4 (MQ=255) gCTAATGACGCCGTGCATTTGCACGGCGGCGATATTGTTGGCTATCGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTgggcggca > 1:740781/1‑243 (MQ=255) 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1:837060/223‑3 (MQ=255) cGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTg > 1:4865/1‑142 (MQ=255) cGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGttt > 1:431533/1‑251 (MQ=255) cGCCTGGTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCCTGGCGAATCAATTTAATCGCCTGCTTGCCGGTCTCCACATTGTCGTATTGGGCGGCACCGATATGGTCAACGATTTGCTTAATAAACTCCTTAATTGAGGttt > 1:31476/1‑251 (MQ=255) gTCTTCGCGGTTGGTGACCGGCTCAAGGTATTTGACGATGATTTGGTTTGCCTGCTTATCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCGTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGt < 1:391325/137‑1 (MQ=255) 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ATCGCGGTCGGGCAGATTAACCTGGATAACATCACCCGGGCGCAACTCCGAGTCTCGCATATCAAACGTGATTTTGAGCCGTGTAAGCCCGCTTGCAATCATCTCCAAATCGCGCTGCGCTAACCGCGCTGCTAAGTCAAACGTCGGCACGCCTTTGTATTCAACGGTTTTGCTAATGACGCCGTGCATTTGCACCGCAGCAATATTGTTGGCAATCGCCTGGTCTTCGCGATTTGTCACCGGCTCACGGTATTTAACGATAACCTGATTTGCCTGCTTGTCGGTTGCGGCGCTGTCATCATCAAGCACCGCAACAATCCCTTTGTCATAGCTAAACAGCGGTAAATCCGCTACATTGTAGTCTTGCCGAATCAATTTAATCGCCTGTTTACCGGTCTCCACATTGTCGTATTGCGCCGCCCCGATATGATCAACAATTTGCTTAATAAAATCTTTAATGGAGGTTTGCCGGTTGTAGCGGATACAGAGGCCA > 1/1483661‑1484153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |