| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,464,493 | A→C | intergenic (‑19865/‑177271) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,464,493 | 0 | A | C | 100.0% | 102.3 / NA | 38 | intergenic (‑19865/‑177271) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (20/18); total (20/18) | |||||||||||
CGTGCAATATCTGTACGAGTGCCATCATTAATCCATACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTACTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGATTGTATATATTTTTGTTGAGC > 1/1464262‑1464728 | cGTGCAATATCTGTACGAGTGCCATCATTAATCCATACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATtat < 1:806589/250‑1 (MQ=255)cGTGCAATATCTGTACGAGTGCCATCATTAATCCATACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATtat < 1:665777/250‑1 (MQ=255) cTGTACGAGTGCCATCATTAATCCATACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTatat < 1:278229/242‑1 (MQ=255) ccATCATTAATCCATACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAAc < 1:158677/251‑1 (MQ=255) aTACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAAc < 1:70656/238‑1 (MQ=255) gCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGAc < 1:500983/222‑1 (MQ=255) ggAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTc < 1:253199/186‑1 (MQ=255) tCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATg < 1:112977/250‑1 (MQ=255) cAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGa > 1:447403/1‑247 (MQ=255) atatCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGAc > 1:807001/1‑198 (MQ=255) aTTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCg < 1:873485/214‑1 (MQ=255) aTTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAatcatc < 1:696845/246‑1 (MQ=255) aTTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTg > 1:368439/1‑251 (MQ=255) tatCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACg > 1:47760/1‑251 (MQ=255) tAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTgaga > 1:748283/1‑161 (MQ=255) gatgatAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGAc > 1:210381/1‑150 (MQ=255) tGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATtat > 1:677840/1‑130 (MQ=255) ctctAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGAtt > 1:122913/1‑251 (MQ=255) tCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGccc < 1:54007/251‑1 (MQ=255) gTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAAttt > 1:632218/1‑251 (MQ=255) ctgtATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAAt > 1:599711/1‑251 (MQ=255) gtATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAAtt > 1:694968/1‑250 (MQ=255) gtATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAAtt > 1:353022/1‑250 (MQ=255) ttCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATaa > 1:583745/1‑250 (MQ=255) aTGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAAc < 1:37753/173‑1 (MQ=255) tGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATc > 1:518605/1‑250 (MQ=255) gTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCg < 1:538313/145‑1 (MQ=255) gTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAg < 1:230251/191‑1 (MQ=255) aTTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACC‑AAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAAc > 1:688886/1‑233 (MQ=255) ttACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGAt > 1:396394/1‑244 (MQ=255) aCTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGAt < 1:329065/251‑1 (MQ=255) aCTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTa < 1:385522/217‑1 (MQ=255) aCTAATTGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAAAAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGTTTGTATATATTTttgttg > 1:518464/1‑251 (MQ=255) ttGCTGTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGATTGTATATATTTTTGTTGAGc > 1:183232/1‑249 (MQ=255) gTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGc > 1:853669/1‑154 (MQ=255) gTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGa < 1:330994/209‑1 (MQ=255) gTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGAt < 1:358664/224‑1 (MQ=255) gTTTTGTTCCTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGATTGTATATATTTttgttg > 1:568254/1‑241 (MQ=255) | CGTGCAATATCTGTACGAGTGCCATCATTAATCCATACTGAAGCATTAGATTTTAAAATGGAGTCAATATCAGGAGTATTTAATTCAATATCAAAATAGGCATTCCAAGATGATAATTCTTGCGATAACGCATTCTCTAAATCTAATAACTGTTTTGGTCTGTCTGTATTTTCTTTGCCATCAATGTATTTACTAAACTTAGAAAATAAATTTACTAATTGCTGTTTTGTTACTTGCCAATGTTCATTATATTGAGACATTGACTCTACAACTTCGCCAAGTAATTTACCGAAAACGCTACTATCTTTTGATGTAAAATCATCTGTTGCGTTTTTAACGGCAGGCAGAAAATAAACTTCACCAAAAATGCCTTTAGCAACAGATTTCAGCCCCATGAAATTTGTTTTTTCTAATTCATAACTGAATGTTAGATCCAAAATATTTGATTGTATATATTTTTGTTGAGC > 1/1464262‑1464728 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |