| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,444,816 | A→C | intergenic (‑188/‑196948) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,444,816 | 0 | A | C | 100.0% | 231.1 / NA | 81 | intergenic (‑188/‑196948) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (40/41); total (40/41) | |||||||||||
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< 1:646392/209‑1 (MQ=255) gTATTATGCGGATATTGCCTTTACTCGTCAACCATTTTTTTCGGAAAACAAATAAAATTAAGATATTCGGATATAGATTAAACAAATCGCCTTAATTTTATTCACAAGTCCCTACAAACTTGCTCATTCCCTTGG‑‑‑CGCCATTGGCAAACCAACATTTAAAAAACACTATTTTTTATCACCGCACTTTAAGGCTGTAAACGCTTAttc < 1:279241/207‑1 (MQ=255) gTATTATGCGGATATTGCCTTTACTCGTCAACCATTTTTTTCGGAAAACAAATAAAATTAAGATATTCGGATATAGATTAAACAAATCGCCTTAATTTTATTCACAAGTCCCTACAAACTTGCTCATTCCCTTGG‑‑‑CGCCATTGGCAAACCAACATTTAAAAAACACTATTTTTTATCACCGCACTTTAAGGCTGTAAACGCTTATTCTTCACTTAAACGACGCAATAAACTGCCGTCAAATAACGCCCttt > 1:611921/1‑251 (MQ=255) gTATTATGCGGATATTGCCTTTACTCGTCAACCATTTTTTTCGGAAAACAAATAAAATTAAGATATTCGGATATAGATTAAACAAATCGCCTTAATTTTATTCACAAGTCCCTACAAACTTGCTCATTCCCTTGG‑‑‑CGCCATTGGCAAACCAACATTTAAAAAACACTATTTTTTATCACCGCACTTTAAGGCTGTAAACGCTTATTCTTCAATTAAACGACGCAATAAACTGCCGTCAAATAACGCCCttt > 1:124096/1‑251 (MQ=255) attatGCGGATATTGCCTTTACTCGTCAACCATTTTTTTCGGAAAACAAATAAAATTAAGATATTCGGATATAGATTAAACAAATCGCCTTAATTTTATTCACAAGTCCCTACAAACTTGCTCATTCCCTTGG‑‑‑CGCCATTGGCAAACCAACATTTAAAAAac > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |