| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 307,244 | 0 | T | C | 100.0% | 254.5 / NA | 89 | intergenic (‑39884/+37361) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/44); total (45/44) | |||||||||||
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(MQ=255) tataTTCGCCTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGACTGCAGCTGGCTGGTCATGTCTTCCATGCCCGGAGGCGCCATAATTTcc < 1:360420/251‑1 (MQ=255) atatTCGCCTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGAtt > 1:622820/1‑189 (MQ=255) atatTCGCCTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGACTGCAGCTGGCTGGTCATGTCTTCCATGCCCGGAGGCGCCATAATTTCCa > 1:282896/1‑251 (MQ=255) atatTCGCCTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCCTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGACTGCAGCTGGCTGGTCATGTCTTCCATGCCCGGAGGCGCCATaa < 1:448903/245‑1 (MQ=255) atTCGCCTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGACCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGAc < 1:127702/200‑1 (MQ=255) tCGCCTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGACTGCAGCTGGCTGGTCATGTCTTCCATGCCCGGAGGCGCCATAATTTCCACGcc < 1:103786/251‑1 (MQ=255) ccTTTCTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTCCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGACTGCAGCTGGCTGGTCATGTc > 1:53992/1‑215 (MQ=255) | GTCAGAATGCGCTCAAAATCACCGGCGGTGAGTGCCGACAATTCCACGCGAATCGGCAAACGCCCCTGTAATTCCGGGATCAAATCGGACGGGCGCGCCACTTGGAATGCGCCGGAGGCAATAAACAGAATATGATCGGTTTTCACCATGCCGTGCTTGGTGTTAACGGTAGAACCTTCCACCAGTGGTAGCAAGTCGCGCTGCACACCTTCACGGGACACATCCGCCCCGCTATATTCGCCTTTTTTACAGATTTTATCAATTTCATCAATAAACACGATACCGTTTTGTTCCACCGCATCAATAGCTTTTTGTTTCAGCTCTTTCGGATTCACCAATTTCGCCGCCTCGTCATCAACTAAGGTTTTTAACGCATCCTTAATTTTCATTTTGCGCTTTTTGGTTTGCCCGCTGGACAGATTCTGGAACATGGACTGCAGCTGGCTGGTCATGTCTTCCATGCCCGGAGGCGCCATAATTTCCACGCC > 1/306999‑307486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |