| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,423,156 | A→C | intergenic (‑2143/+21090) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gln‑TTG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,423,156 | 0 | A | C | 100.0% | 149.2 / NA | 56 | intergenic (‑2143/+21090) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gln‑TTG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (25/31); total (25/31) | |||||||||||
CCCGCTCAGGTGTTAAATATGTTTTTGACCCAAATTGCCAAAACCAACACAATTCCGCTCAGTTTGGATTATCAGCCGAATACAAAAACAGCTAATGCAATCAATGAATTAATGAGCGGAAAAGGGGAAAGATTTAGCGTAGATTCCTTTGATGAATTTCAACAAAAAATTCGTGATTTAAGCAAATAAAAAGGATTTTCATGGATTACGTTTTATCAAAAGAATATAAACGGGACTTAAAAAAAATTCCGGTCGAAATTCAATCCGGTCCGGAATATGCAGAGGTTTTATATTGCCTGTTCAATCAAAAATCCCTACCCGAACGATATAAAGATCATGCTTTGCAAGGAAATTGGCAGGGATTTCGAGATTGCCACATCAAAAATGATCTCATTTTAATTTACAAAATAGAAGCAGACACCCTCTATTTTGCAAGGCTAAATTCTCACTCGGAAGTGTTTAAATAAAATTCATATCCATTACATATTAGAG > 1/1422911‑1423402 | cccGCTCAGGTGTTAAATATGTTTTTGACCCAAATTGCCAAAACCAACACAATTCCGCTCAGTTTGGATTATCAGCCGAATACAAAAACAGCTAATGCAATCAATGAATTAATGAGCGGAAAAGGGGAAAGATTTAGCGTAGATTCCTTTGATGAATTTCAACAAAAAATTCGTGATTTAAGCAAATAAAAAGGATTTTCATGGATTACGTTTTATCAAAAGAATATAAACGGGACTTAAAAAAACTTCCg > 1:106818/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |