| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,407,911 | C→T | intergenic (+248331/+13026) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,407,911 | 0 | C | T | 100.0% | 134.2 / NA | 51 | intergenic (+248331/+13026) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (26/25); total (26/25) | |||||||||||
TTTAACTACATTTTTAAATAGTATGCCTAAAATCGTTCTTATCAGACATGTAACACCGTTAGTTGATGGAAGTAAATGTAACGCCACTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAACAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTACATTGGAGGATCTAAAAGAGTTTGATCTTAAAATAACAAATATGCCTAAAATAAAACTAACGCTTAATTCATGGTTTATTCTTTCCAGAATCTTATGGCTACTGGGACTAAACAAAACACAAAAAAATATTGGTGAAGAAAAAAAGCGCGTTAAGAAATTAATGCCAACCTTACTAAAACAAGATTGCTGTATTG > 1/1407678‑1408141 | tttAACTACATTTTTAAATAGTATGCCTAAAATCGTTCTTATCAGACATGTAACACCGTTAGTTGATGGAAGTAAATGTAACGCCACTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAATAGCAAACGCTTTATTcc < 1:164509/251‑1 (MQ=255) tttAAATAGTATGCCTAAAATCGTTCTTATCAGACATGTAACACCGTTAGTTGATGGAAGTAAATGTAACGCCACTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGCTGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAATAGCAAACGc > 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1:324451/214‑1 (MQ=255) aaGTAAATGTAACGCCACTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAATAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTACATTggag > 1:805258/1‑208 (MQ=255) tAAATGTAACGCCACTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAATAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTACATTGGAGGATCTAAAAGAGTTTGATCTTAAAATAACAAATATGCCtaaaat < 1:576342/249‑1 (MQ=255) cTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAATAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTACATTGGAGGATCTAAAag > 1:683156/1‑201 (MQ=255) gTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAATAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTAc < 1:41479/164‑1 (MQ=255) 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gagCACAAAAAATAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTACATTGGAGGATCTAAAAGAGTTTGATCTTAAAATAACAAATATGCCTAAAATAAAACTAACGCTTAAtt > 1:192362/1‑117 (MQ=255) | TTTAACTACATTTTTAAATAGTATGCCTAAAATCGTTCTTATCAGACATGTAACACCGTTAGTTGATGGAAGTAAATGTAACGCCACTGTTGCTCAAAATCGTTTGGTCGAATATAACGAAACCGAACGCTTGGCATTAGATGAAATAAATTCCTTCAAACAAAGTACTGCATATCAAGAGATGTTAACAATTCCCAAAATATTTGTTTCTCCTATGATAAGAGCACAAAAAACAGCAAACGCTTTATTCCCAAGTAATGAATTAATTACATTGGAGGATCTAAAAGAGTTTGATCTTAAAATAACAAATATGCCTAAAATAAAACTAACGCTTAATTCATGGTTTATTCTTTCCAGAATCTTATGGCTACTGGGACTAAACAAAACACAAAAAAATATTGGTGAAGAAAAAAAGCGCGTTAAGAAATTAATGCCAACCTTACTAAAACAAGATTGCTGTATTG > 1/1407678‑1408141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |