| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,406,186 | T→C | intergenic (+246606/+14751) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,406,186 | 0 | T | C | 100.0% | 163.0 / NA | 58 | intergenic (+246606/+14751) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/26); total (32/26) | |||||||||||
CGCCAAACACATTGATGCCAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGCGCTTGACTTCATACTTGAGAACAATTATCATTTAGATCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATGAAATTCTTTCCGAACAGGATTTAAT > 1/1405955‑1406429 | cGCCAAACACATTGATGCCAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAg < 1:722331/251‑1 (MQ=255) gCCAAACACATTGATGCCAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGa > 1:807274/1‑251 (MQ=255) caTTGATGCCAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCa > 1:125564/1‑249 (MQ=255) aTGCCAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCaa > 1:666858/1‑250 (MQ=255) ccAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACAt < 1:417453/250‑1 (MQ=255) ccAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACAt < 1:520209/250‑1 (MQ=255) ccAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACAt < 1:316178/250‑1 (MQ=255) ccAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACAt < 1:680064/250‑1 (MQ=255) gATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAg > 1:259192/1‑251 (MQ=255) tGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGcc < 1:673662/251‑1 (MQ=255) aCTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTcccc > 1:548910/1‑250 (MQ=255) cTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAg > 1:182580/1‑205 (MQ=255) gtgtGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATc < 1:745302/201‑1 (MQ=255) aGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAAtt > 1:710562/1‑251 (MQ=255) gCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCGTTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAAttt > 1:429910/1‑251 (MQ=255) tGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGATTCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGGGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTgccg > 1:48657/1‑250 (MQ=255) tGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTgccg > 1:375896/1‑250 (MQ=255) tGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGATAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATTATTAAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTgccg > 1:549718/1‑250 (MQ=255) gTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACAt > 1:740635/1‑183 (MQ=255) gTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTaaaaaaa > 1:896748/1‑251 (MQ=255) tttGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTaaaaaa < 1:42697/249‑1 (MQ=255) ccACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAAt > 1:558320/1‑149 (MQ=255) ccACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAAtctc < 1:543538/251‑1 (MQ=255) gCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTaaaaaa > 1:446309/1‑222 (MQ=255) cACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATaa < 1:113189/250‑1 (MQ=255) cTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGt < 1:197214/251‑1 (MQ=255) aTTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGcc < 1:621514/251‑1 (MQ=255) aaGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTaa > 1:879198/1‑251 (MQ=255) gTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAAt > 1:660777/1‑175 (MQ=255) gTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCG‑TTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACAt > 1:858216/1‑251 (MQ=255) cGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGa < 1:718078/249‑1 (MQ=255) cGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGa < 1:274875/249‑1 (MQ=255) ggTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTg > 1:12097/1‑228 (MQ=255) cGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATg < 1:539890/251‑1 (MQ=255) ccATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAGTTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTACCAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGaa > 1:190374/1‑251 (MQ=255) ccATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACAt > 1:184211/1‑226 (MQ=255) tttatttGATAATTATTTTCATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATAc < 1:575121/251‑1 (MQ=255) cATTAAGGTGCTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGc < 1:569859/183‑1 (MQ=255) gtgcTTGACTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGgtg > 1:292832/3‑251 (MQ=255) aCTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATg < 1:889980/250‑1 (MQ=255) aCTTCATATTTGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATg < 1:766972/250‑1 (MQ=255) tttGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTccc < 1:680481/73‑1 (MQ=255) tttGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGt < 1:544374/157‑1 (MQ=255) tttGAGAACAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCAGTGTAGATGAAATTCttt > 1:390945/2‑251 (MQ=255) cAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATaa > 1:284047/1‑147 (MQ=255) cAATTATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGa > 1:493765/1‑179 (MQ=255) ttATCATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACAt > 1:852844/1‑171 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGt > 1:421902/1‑143 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGt < 1:177535/143‑1 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGt < 1:424028/154‑1 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACAt < 1:454260/167‑1 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACa > 1:239781/1‑179 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATAc > 1:798268/1‑195 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATGAAATTCTTTCCGAACAGGATTTaa > 1:333360/1‑251 (MQ=255) cATTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATGAAATTCTTTCCGAACAGGATTTaa > 1:517629/1‑251 (MQ=255) aTTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCt > 1:315048/1‑147 (MQ=255) aTTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGt < 1:386782/197‑1 (MQ=255) aTTTAGACCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATGAAATTCTTTCCGAACAGGATTTAAt < 1:763663/251‑1 (MQ=255) | CGCCAAACACATTGATGCCAGATATGACGAATTACTTCATCAGGCGCTGAAAGAAGGTGTGGAAGCCTATGCTTATGCCGCTGAGTTTGAAAAAACACAAGGCATTCCCACCGCACTTAATTTAACTAAAGTGGCACCGTTTAAAGCGGGTTAAGTTTGAATCGCCATTTATTTGATAATTATTTTCATTAAGGCGCTTGACTTCATACTTGAGAACAATTATCATTTAGATCATTCAAACAATAAAATAGATAATCACTCCAACATTTAGCGCCTCCTCCCCCACAAAAGAGGCGTTTTTTTTGCCTGAAATTTGCCGCCCCGGGGTAAAAAAAATTCAAATTTGTCGAATAATCTCTATAATGTAGCCTTTCTGTAATTGAATAACATTAGGAAGTAACATGACTGATATGAATACCGTTCTCGCAGAACTAAAGCGCGGTGTAGATGAAATTCTTTCCGAACAGGATTTAAT > 1/1405955‑1406429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |