| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,388,526 | C→T | intergenic (+228946/+32411) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,388,526 | 0 | C | T | 100.0% | 181.5 / NA | 67 | intergenic (+228946/+32411) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (31/36); total (31/36) | |||||||||||
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aaGCAGGTTTGATTGTTTCCGGTGTTGCGTTAGTATTAAACGCGTTAACCGATTCCGGCTTAATTTTCTTACTGAAACCCTTATTGGATGATGGTTTTGGCAAAGCTGACGCTTCTTTTTTAAAACAAATGTCGGTATTTGTGGTGCTGCTGATTCTCTTTCGCGGCATTTCCAGCTTTATTTCCAATTACTGTCTGGCATGGGTCTCCGGCAAAGTAGTGATGACCATGCGCCGCCGTTTGTTTAAaca > 1:186619/1‑250 (MQ=255) ttGATTGTTTCCGGTGTTGCGTTAGTATTAAACGCGTTAACCGATTCCGGCTTAATTTTCTTACTGAAACCCTTATTGGATGATGGTTTTGGCAAAGCTGACGCTTCTTTTTTAAAACAAATGTCGGTATTTGTGGTGCTGCTGATTCTCTTTCGCGGCATTTCCAGCTTTATTTCCAATTACTGTCTGGCATGGGTCTCCGGCAAAGTAGTGATGACCATGCGCCGCCGTTTGTTTAAACACTTAATGtt < 1:763756/251‑1 (MQ=255) tGATTGTTTCCGGTGTTGCGTTAGTATTAAACGCGTTAACCGATTCCGGCTTAATTTTCTTACTGAAACCCTTATTGGATGATGGTTTTGGCAAAGCTGACGCTTCTTTTTTAAAACAAATGTCGGTATTTGTGGTGCTGCTGATTCTCTTTCGCGGCATTTCCAGCTTTATTTCCAATTACTGTCTGGCATGGGTCTCCGGCAAAGTAGTGATGACCATGCGCCGCCGTTTGTTTAAACACTTAATGTTc < 1:547300/251‑1 (MQ=255) | CAAATCAGTCTATTGTTCTACAATGAAGAGATCAAAATTCAGACCGCGCGCGCTGAATTTTCGCCTTGGTATCGCAGATTGATTGGCTTGAGCACGAAATAAAGGTACAATGCGCCATTATTTTTTAACCTAAGACAGAAAATTTATTATGCAAGATCAAGACCTTTCCACCATGCAAACCTTCAAACGTTTATGGCCGATGATTAGCCCGTATAAAGCAGGTTTGATCGTTTCCGGTGTTGCGTTAGTATTAAACGCGTTAACCGATTCCGGCTTAATTTTCTTACTGAAACCCTTATTGGATGATGGTTTTGGCAAAGCTGACGCTTCTTTTTTAAAACAAATGTCGGTATTTGTGGTGCTGCTGATTCTCTTTCGCGGCATTTCCAGCTTTATTTCCAATTACTGTCTGGCATGGGTCTCCGGCAAAGTAGTGATGACCATGCGCCGCCGTTTGTTTAAACACTTAATGTTC > 1/1388298‑1388772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |