| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 300,438 | C→T | intergenic (‑33078/+44167) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 300,438 | 0 | C | T | 100.0% | 242.5 / NA | 89 | intergenic (‑33078/+44167) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (44/45); total (44/45) | |||||||||||
GCTCGGCGATAGCTTCTTTTTGTTTCGCCAACTGCGCCCGGGTATCCTGTAACTCTGCAATGAGCTTCATGCGCGCCCGATTCAAATGGGCGTAATACGCTTTCATACGCTCCGCATTTTGCCCCTTATCGGACAATATCCGCTCCGCCACGGAAGGATTGACGCCGGAACGATAAGCAGCATCCAACTGCTTCGCCAGTTTCGCTTTTTGTTCTTTTTCCTGCTTTTGTAATTGCCTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATCTGCTGGTGGATTTTCGACAAATCCTGCTGCGCGGCAAAAACGGAAGGCGCGGCACATAAAAGTGCGGTG > 1/300202‑300680 | gCTCGGCGATAGCTTCTTTTTGTTTCGCCAACTGCGCCCGGGTATCCTGTAACTCTGCAATGAGCTTCATGCGCGCCCGATTCAAATGGGCGTAATACGCTTTCATACGCTCCGCATTTTGCCCCTTATCGGACAATATCCGCTCCGCCACGGAAGGATTGACGCCGGAACGATAAGCAGCATCCAACTGCTTCGCCAGTTTCGCTTTTTGTTCTTTTTCCTGCTTTTGTAATTGCTTGATTTGCTTATCg > 1:73894/1‑251 (MQ=255) 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tGACGCCGGAACGATAAGCAGCATCCAACTGCTTCGCCAGTTTCGCTTTTTGTTCTTTTTCCTGCTTTTGTAATTGCTTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATc < 1:61009/251‑1 (MQ=255) tGACGCCGGAACGATAAGCAGCATCCAACTGCTTCGCCAGTTTCGCTTTTTGTTCTTTTTCCTGCTTTTGTAATTGCTTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATc < 1:618769/251‑1 (MQ=255) cGGAACGATAAGCAGCATCCAACTGCTTCGCCAGTTTCGCTTTTTGTTCTTTTTCCTGCTTTTGTAATTGCTTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATCTGCtgg < 1:63969/251‑1 (MQ=255) 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ttttGTAATTGCTTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATCTGCTGGTGGATTTTCGACAAATCCTGCTGCGCGGCAAAAACGGAAGGCGCGGCACATAAAAGt > 1:338354/1‑249 (MQ=255) gTAATTGCTTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATCTGCTGGTGGATTTTCGACAAATCCTGCTGCGCGGCAAAAACGGAAGGCGCGGCACATAAAAGTGCGGTg > 1:829255/1‑251 (MQ=255) | GCTCGGCGATAGCTTCTTTTTGTTTCGCCAACTGCGCCCGGGTATCCTGTAACTCTGCAATGAGCTTCATGCGCGCCCGATTCAAATGGGCGTAATACGCTTTCATACGCTCCGCATTTTGCCCCTTATCGGACAATATCCGCTCCGCCACGGAAGGATTGACGCCGGAACGATAAGCAGCATCCAACTGCTTCGCCAGTTTCGCTTTTTGTTCTTTTTCCTGCTTTTGTAATTGCCTGATTTGCTTATCGGTATCGCTAATATTTTTACGGATTGCTTTCAAATCCGATTCCGTTTGACGCAACTGCCCGATCACGTTATTGATTTGGTTTTCTTGTGTTTTCAGAGTGGATTGCAACTTTTGTTGCTCGGCTTTCTGCGAAGCAATTTTTTGTTCCTGTTGCTTAATCTGCTGGTGGATTTTCGACAAATCCTGCTGCGCGGCAAAAACGGAAGGCGCGGCACATAAAAGTGCGGTG > 1/300202‑300680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |