| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,357,969 | C→T | intergenic (+198389/+62968) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,357,969 | 0 | C | T | 100.0% | 174.8 / NA | 61 | intergenic (+198389/+62968) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/24); total (37/24) | |||||||||||
AGTGCGTTTTGTTGTGGGTTTCATAAATCCTCGTGTCGCTTTCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAATGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATTACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGACCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGAATTAGTTACCAAAGAATAGGTGGAT > 1/1357737‑1358214 | aGTGCGTTTTGTTGTGGGTTTCATAAATCCTCGTGTCGCTTTCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAATGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGtt > 1:747495/1‑251 (MQ=255) aaaTCCTCGTGTCGCTTTCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAAGGGCGTACCCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCA‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGc < 1:96602/251‑1 (MQ=255) aTCCTCGTGTCGCTTTCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAATGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAg > 1:316963/1‑251 (MQ=255) tcgttttCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAAGGGCGTACCCGCGCCGCTGCCTTCGCGGAAGATCCCCGGCGTGTCTCCGTTTAAATCCCCCCCCGTTGTCGGTTTTTGTCCA‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAAt < 1:490629/246‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCCAAGCGTTTGTTTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAAGGGCGTACCCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCCCCGGCGTGTCTCCGTTTAAATCCCCCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAAt < 1:520090/250‑1 (MQ=255) tCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAATGGCGTACCCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCCCCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCCCCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATc < 1:547100/245‑1 (MQ=255) tCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCAAATCTAAAAAAAGGGCGTACCCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAACCCCCCACCGTTGTCGGTTCTTGCCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGc < 1:46085/250‑1 (MQ=255) taaatAAGTATATAATCAAAAAAAAGGGCGTACCCGCGCCGTTCCCTTCCCGCAAGATCACGGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCCCCCCCGTTGTCGGTTCTTGTCCA‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATcc < 1:885454/247‑1 (MQ=255) gTATCTAATCTAAATAAATGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCgg > 1:328669/1‑219 (MQ=255) atctaatctaAATAAATGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAAtt > 1:241046/1‑251 (MQ=255) aaataaatGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATc > 1:795371/1‑250 (MQ=255) acccGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATCCCCGGCGTGTCTCCGTTTAAATCCCCCCCCGTTGTCGTTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGc < 1:158997/249‑1 (MQ=255) acccGCCCCGCTGCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCGGGTAAAACCCCCCCCCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGc < 1:649777/249‑1 (MQ=255) gCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATcc > 1:449/1‑226 (MQ=255) gCCTTCACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTg > 1:730911/1‑250 (MQ=255) gCCTTCACGAAAGATCGCGGGGGTGTCTCCGGTAAAATCCACCACTGTTGTCGTTTCTTGCCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAg < 1:153636/201‑1 (MQ=255) cACGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAAt > 1:824420/1‑175 (MQ=255) aCGCAAGATCACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTgg > 1:217570/1‑251 (MQ=255) aaagatcaccggctggcctcCGGTTAAACCCCCCACCGTTGTCGGTTCTT‑TCCCAAAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACg < 1:138348/234‑1 (MQ=255) gatcaCCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCa > 1:270367/5‑251 (MQ=255) tcaCCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCAtt > 1:801131/3‑251 (MQ=255) cGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCCCCCCCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGc < 1:615722/251‑1 (MQ=255) cGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGc < 1:637676/251‑1 (MQ=255) cGGCGTGTCCCCGTTAAAACCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGCCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGc < 1:787666/251‑1 (MQ=255) gCGTGTCTCCGTTTAAATCCCCCCCCGTTGTGGGTTCTTGTCCA‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCg < 1:900932/221‑1 (MQ=255) gtCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGAcgcg > 1:37345/1‑251 (MQ=255) tctcCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATcc > 1:704748/1‑201 (MQ=255) ccGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCaa > 1:642853/1‑251 (MQ=255) ggTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTgcgc > 1:723863/1‑223 (MQ=255) gTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAAtt > 1:415965/1‑250 (MQ=255) gTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAAtt > 1:626174/1‑250 (MQ=255) atccccccccGTTGTCGGTTTTTGTCCA‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTgg < 1:657662/243‑1 (MQ=255) aTCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATg < 1:675634/108‑1 (MQ=255) aTCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGaa > 1:223167/1‑200 (MQ=255) ccgctGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGtt > 1:603539/5‑251 (MQ=255) gTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTaa > 1:55512/1‑251 (MQ=255) ctCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTaa < 1:161696/250‑1 (MQ=255) aaTAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGccc > 1:24889/1‑250 (MQ=255) aaTAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGccc > 1:412435/1‑250 (MQ=255) gccgTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCgtgt > 1:707098/1‑251 (MQ=255) gAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATg > 1:75468/1‑67 (MQ=255) gAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAAt > 1:679178/1‑103 (MQ=255) taatTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTaaaa > 1:34990/1‑219 (MQ=255) atTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAAt > 1:323409/1‑251 (MQ=255) atTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAAt > 1:677958/1‑251 (MQ=255) aaTCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAAt > 1:611167/1‑94 (MQ=255) ccACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAAtg < 1:495638/216‑1 (MQ=255) cACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGt > 1:137382/1‑251 (MQ=255) aCCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTa > 1:299536/1‑251 (MQ=255) cTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTaa < 1:712536/217‑1 (MQ=255) aTGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCg < 1:385292/250‑1 (MQ=255) gTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGaa > 1:287943/1‑251 (MQ=255) gTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGaa > 1:796208/1‑251 (MQ=255) ttCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTAttt > 1:162947/1‑229 (MQ=255) tCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGt < 1:412353/188‑1 (MQ=255) aTCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTAACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATCACTGTGTaa > 1:292212/1‑202 (MQ=255) tCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTgcgc < 1:832514/144‑1 (MQ=255) tCACGGATCTCTTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGAATTAGTTACCaa > 1:162755/1‑251 (MQ=255) ctctTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGAATTAGTTACCAAAGAATAgg < 1:236984/251‑1 (MQ=255) ctTCCGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGAATTAGTTACCAAAGAATAGGTg > 1:315060/1‑251 (MQ=255) ccGGATCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGAATTAGTTACCAAAGAATAGGTGGAt < 1:174736/251‑1 (MQ=255) | AGTGCGTTTTGTTGTGGGTTTCATAAATCCTCGTGTCGCTTTCCCAAGCGTCTGTGTTAATTTAACTAAGTATCTAATCTAAATAAATGGCGTAACCGCGCCGCTGCCTTCACGCAAGATTACCGGCGTGTCTCCGGTTAAATCCACCACCGTTGTCGGTTCTTGTCCC‑AAATAACCGCCGTGAATAATTAAATCCACCTGATGTTCCAAACGATCACGGATCTCTTCCGGACCCGATTGCGTCAAATGTTCTTCATTCGGTAGCATCAACGAGCAGGATAAAATCGGTTCACCAAGGGCTTTTAGTAAATCCAACGCAATTTGGTTATCCGGCACGCGAATGCCGATGGTTTTGCGCTTGGACGTCATTAAGCGACGCGGCAATTCTTTGGTTGCCGTTAAAATAAATGTGTAACGCCCCGGCGTGTTATTTTTAATCAAACGGTAAGCGGAATTAGTTACCAAAGAATAGGTGGAT > 1/1357737‑1358214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |