| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,348,027 | G→A | intergenic (+188447/+72910) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,348,027 | 0 | G | A | 100.0% | 165.0 / NA | 63 | intergenic (+188447/+72910) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/31); total (32/31) | |||||||||||
ACAGTTAATATTTTGCAAAATCGGCTTAAGTAAATAAACCAACCTTGCGTAGAATAACTTTTTAGTCACATTGTTCATAAATACGCTGTTTTAATAAATGCTCCTCTAGCTATCACAATTTATCAAATTTTGATAAGCGATCTGTTTACAGATCTCTGTATTGTAGTTTTACTTACTTACCAGTGCACTTGTGCCGATAACCTTAAAATCATTTTTGACAGTAATTGTACATATGGTTATAGTGCCTTGAAAACCATCCAAAGAAATCGAACTATTTGATAGTTATAAGGATTTAAACTGCTTAGCCAGTTGGCTATTATTTAGCGGTCAGCAAGTCGCAACACTTAGTGATCTTTATCATAAAGATTTTTGGAATTGTATTAGAAAATCAGATTATCCAAATGCCCATGGTTATTTGGATGGTATAGAGATTACCAATGAATCATTCCACACGTTACTTCCGCGTTTTATCAATGACGA > 1/1347793‑1348272 | aCAGTTAATATTTTGCAAAATCGGCTTAAGTAAATAAACCAACCTTACGTAGAATAACTTTTTAGTCACATTGTTCATAAATACGCTGTTTTAATAAATACTCCTCTAGCTATCACAATTTATCAAATTTTGATAAGCGATCTGTTTACAGATCTCTGTATTGTAGTTTTACTTACTTACCAGTGCACTTGTGCCGATAACCTTAAAATCATTTTTGACAGTAATTGTACATATAGTta > 1:834970/1‑239 (MQ=255) 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> 1:219575/1‑155 (MQ=255) gTTTTAATAAATACTCCTCTAGCTATCACAATTTATCAAATTTTGATAAGCGATCTGTTTACAGATCTCTGTATTGTAGTTTTACTTACTTACCAGTGCACTTGTGCCGATAACCTTAAAATCATTTTTGACAGTAATTGTACATATAGTTATAGTGCCTTGAAAACCATCCAAAGAAATCGAACTATTTGATAGTTATAAgg < 1:145881/203‑1 (MQ=255) gTTTTAATAAATACTCCTCTAGCTATCACAATTTATCAAATTTTGATAAGCGATCTGTTTACAGATCTCTGTATTGTAGTTTTACTTACTTACCAGTGCACTTGTGCCGATAACCTTAAAATCATTTTTGACAGTAATTGTACATATAGTTATAGTGCCTTGAAAACCATCCAAAGAAATCGAACTATTTGATAGTTATAAGGATTTAAACTGCTTAGcc > 1:593446/1‑220 (MQ=255) gTTTTAATAAATACTCCTCTAGCTATCACAATTTATCAAATTTTGATAAGCGATCTGTTTACAGATCTCTGTATTGTAGTTTTACTTACTTACCAGTGCACTTGTGCCGATAACCTTAAAATCATTTTTGACAGTAATTGTACATATAGTTATAGTGCCTTGAAAACCATCCAAAGAAATCGAACTATTTGATAGTTATAAGGATTTAAACTGCTTAGCCAGTTGGCTATTATTTAGCGGTCAGCAAGTCg > 1:137036/1‑251 (MQ=255) aataaataCTCCTCTAGCTATCACAATTTATCAAATTTTGATAAGCGATCTGTTTACAGATCTCTGTATTGTAGTTTTACTTACTTACCAGTGCACTTGTGCCGATAACCTTAAAATCATTTTTGACAGTAATTGTACATATAGTTATAGTGCCTTGAAAACCATCCAAAGAAATCGAACTATTTGAt < 1:42690/188‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |