| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,337,813 | G→A | intergenic (+178233/+83124) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,337,813 | 0 | G | A | 100.0% | 158.2 / NA | 58 | intergenic (+178233/+83124) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/35); total (23/35) | |||||||||||
AATCATAAGGAATGCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTGGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGTTACCGTTATGTAAATACAAAAAAAGGCAACATAAAATTGCCTTTAAG > 1/1337566‑1338058 | aatCATAAGGAATGCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAgcg < 1:767971/251‑1 (MQ=255) atCATAAGGAATGCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAgcg > 1:627739/1‑250 (MQ=255) atCATAAGGAATGCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAgcg > 1:234135/1‑250 (MQ=255) cATAAGGAATGCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGt > 1:65304/1‑251 (MQ=255) gCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGTAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGt > 1:364180/1‑250 (MQ=255) aCCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTttgtt > 1:291690/1‑251 (MQ=255) ccACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTttgttg > 1:798266/1‑251 (MQ=255) atatCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAgtg < 1:217970/251‑1 (MQ=255) atCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAgtggg < 1:71332/251‑1 (MQ=255) ccGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTaa > 1:35565/1‑251 (MQ=255) tAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAAcc < 1:742990/250‑1 (MQ=255) ggggCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGt < 1:67814/237‑1 (MQ=255) gTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTg < 1:782605/197‑1 (MQ=255) aCATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGa > 1:641277/1‑250 (MQ=255) tatTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCg < 1:844467/246‑1 (MQ=255) tatTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAAt > 1:744870/1‑251 (MQ=255) tatTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAAt > 1:781567/1‑251 (MQ=255) tatTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAAt > 1:443546/1‑251 (MQ=255) tttATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATaa < 1:778785/251‑1 (MQ=255) ttATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAAc < 1:117095/251‑1 (MQ=255) tATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACg < 1:220428/251‑1 (MQ=255) aTGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGa > 1:272182/1‑251 (MQ=255) aTGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGa < 1:468662/251‑1 (MQ=255) aTGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATGGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCTAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAAGTAAGGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGAAAGTTCTACCCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGa < 1:37532/251‑1 (MQ=255) cTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGACATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAAcc > 1:231070/1‑221 (MQ=255) cGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATg < 1:666732/246‑1 (MQ=255) aGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACccgcc < 1:816512/214‑1 (MQ=255) ccATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACct > 1:313171/1‑249 (MQ=255) gAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCTTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac < 1:121941/250‑1 (MQ=255) gAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAGGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTACCCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac < 1:778610/250‑1 (MQ=255) gAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac < 1:27068/250‑1 (MQ=255) aGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaact < 1:449119/250‑1 (MQ=255) gCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAAcc < 1:27328/192‑1 (MQ=255) gatTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac < 1:28754/225‑1 (MQ=255) ttGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac < 1:57280/223‑1 (MQ=255) gCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTttgttg < 1:253527/145‑1 (MQ=255) gggCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAgtg > 1:139956/1‑145 (MQ=255) ggCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATAtttt < 1:610161/250‑1 (MQ=255) tAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAAcc > 1:597027/1‑154 (MQ=255) cTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac > 1:216120/1‑195 (MQ=255) cTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTctaaac < 1:744595/195‑1 (MQ=255) cTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTtattat < 1:25070/249‑1 (MQ=255) cTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTtattat < 1:832196/249‑1 (MQ=255) cTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTtattat < 1:478728/249‑1 (MQ=255) cTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTAttt > 1:797125/1‑251 (MQ=255) ccGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAAttt < 1:53431/236‑1 (MQ=255) ccTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTa > 1:397919/1‑163 (MQ=255) ccTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAac > 1:306191/1‑213 (MQ=255) ccTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTaaaa > 1:162075/1‑251 (MQ=255) gTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCG‑TTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAAc < 1:430000/142‑1 (MQ=255) tGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCaa < 1:102642/107‑1 (MQ=255) cAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGtt > 1:302097/1‑251 (MQ=255) ttCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGTTACCGTTATGt < 1:125754/251‑1 (MQ=255) ccATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGTTACCGTTATGt > 1:131946/1‑249 (MQ=255) gTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGTTACCGTTATGt < 1:38049/239‑1 (MQ=255) cAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATAtttt < 1:48896/158‑1 (MQ=255) cAATTAAAGTGACATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAacac < 1:559998/163‑1 (MQ=255) aCATTAGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGTTACCGTTATGTAAATACAAAAAAAGGCAACATAAAATTGCCTTTAag < 1:5391/251‑1 (MQ=255) | AATCATAAGGAATGCGACGGGAAACCACGATCATATCGCCGTCTTCACCGTAAACCGGGGCAAGTTCTACATATTTATGCTGACGATTTAAGCCAACCATGGAGCCTTGCTCAAAATTGAAATGATGATTGCAGGCATGGGCACGATAACTCAAAGCTTCTACGCCGTCATCTAATGCGCCTGTTGCCAATTCATGCAATAACGGTTTCCATAAATGGGTTTGGTTGCGATCAATTAAAGTGACATTGGCGCGTTTTTTGCGTCCAAGTTTGTTGCCTAAGTGGGTGGCAAGTTCTAACCCGCCGGCGCCACCACCGACAATAACGATGTTTTTCATAACTACCTCTAAACTAAATAAAAAAATTGCAAAATTTAATTAACAATATTTTAACACCAATTTATTATTTTTGCTTAGGGTTGATTTGTAAAAAAGGAAAATACTTCGTTACCGTTATGTAAATACAAAAAAAGGCAACATAAAATTGCCTTTAAG > 1/1337566‑1338058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |