| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,334,391 | A→G | intergenic (+174811/+86546) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,334,391 | 0 | A | G | 100.0% | 129.6 / NA | 47 | intergenic (+174811/+86546) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (23/24); total (23/24) | |||||||||||
TAGTCCCATTCGCGAATACCGAATAAACCTTCAGCGAAGTGCGGACGACCAATCAAGTTATAAAGCTGATCTTTATTCATGCCTTTTTCAATCATACGAACATTGTCCCAGTTCGGCCAGGAACCGAATTGGCTACCGTTATGATTAAATGTAGATTTTTCAATTTGAGGCCATACTAATTCAGAACCTTCGGCAGGAGTACCTTCTTTAGATACTTTACTTAAGTTACCACAAGCAACAAGAGTTACCGCTGCGATTGCAGATAATAAGAAATGTGATAATTTCATCTGTTTTACCTTATTTTTAGGTGAGTAGAACAATCCAAAGGAACCATAGATATAATAAAAAGAAGGCTCAAAAAGCAATAGTGCAACTTCAATTTCAGCTCCGTATGGTAATTACAAAACGGATTAAAGTAAATCCGAATTTTCTATTTTTAATCAATCTGTATAAATAGAATCGAAAAAAATAGGATGTTATATC > 1/1334145‑1334627 | tAGTCCCATTCGCGAATACCGAATAAACCTTCAGCGAAGTGCGGACGACCAATCAAGTTATAAAGCTGATCTTTATTCATGCCTTTTTCAATCATACGAACATTGTCCCAGTTCGGCCAGGAACCGAATTGGCTACCGTTATGATTAAATGTAGATTTTTCAATTTGAGGCCATACTAATTCAGAACCTTCGGCAGGAGTACCTTCTTTAGATACTTTACTTAAGTTACCACAAGCAACAAGAGTTGCCg > 1:294922/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |