| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,325,938 | C→A | intergenic (+166358/+94999) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,325,938 | 0 | C | A | 100.0% | 90.2 / NA | 35 | intergenic (+166358/+94999) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (18/17); total (18/17) | |||||||||||
TGTATCTTGAATTTTGGTTGTCAACCTTACAACAGAAGTGGAAACTATTATATTTTGGCAACAAATATTGTTTATGGTTTAGTTTCTTTAATTTTATACCCTTATTCACGCTTTACTTATGAAGGTATTGTTGAATGCATTGTGGGAGATAATATATTCATCACAGATGCATTATTTATGATGACAGTAAAACTGATAACAATGGCTATCTGTTACTTTTTTGCTTTATTTATCTCACCAATCGGACTCATTTGGCTCTATTTCTATTATTCAAAACAAGAAAAAATAGCCAATCAATCAGAAAATCAACAATAATAAAAAGGACGCTCATGAGCGCCCTTATTTTTTATCTAAACTTTAAAATTAAAGTGCAGATTTTGCTTTTTCAACTAATGCAGCGAAAGCCACTTTGTCGAATACGGCGATATCAGCAAGGATCTTAC > 1/1325733‑1326175 | gtaaaaccctaacaggacctagctcccacccccttatagtattcaataaattcaaaaatatccaaacgacgatctatggtctcgactttatcaataaaagaatacacaacacccaatttttcataaaatgcgcactgtagacctaatttatttcgacgattaagtaataattctcttaaccaaatatgttcattagaatgAATGGATATCTGTTACt > 1:685670‑M2/201‑217 (MQ=255) ccccttatagtattcaataaattcaaaaatatccaaacgacgatctatggtctcgactttatcaataaaagaatacacaacacccaatttttcataaaatgcgcactgtagacctaatttatttcgacgattaagtaataattctcttaaccaaatatgttcattagaatgAATGGATATCTGTTACTTTTTTGCTTTATTTATCTCACCAATCGGACTCATTTGGCTCTATTTCTATTATTCAAAACAAg > 1:336747‑M2/172‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |