| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,311,988 | A→C | intergenic (+152408/+108949) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,311,988 | 0 | A | C | 100.0% | 152.2 / NA | 54 | intergenic (+152408/+108949) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (27/27); total (27/27) | |||||||||||
GTTTTGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTTTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCATGGAAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGAAAATCAATAAGAAAAAACGGGTGGCATTATAACATA > 1/1311753‑1312230 | gTTTTGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTa < 1:80352/250‑1 (MQ=255) tttGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATg < 1:552416/251‑1 (MQ=255) gTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACa < 1:330863/250‑1 (MQ=255) gTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACa < 1:803892/250‑1 (MQ=255) cGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTa < 1:198196/236‑1 (MQ=255) gTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATtaataa < 1:832837/250‑1 (MQ=255) cAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCg > 1:718292/1‑251 (MQ=255) gAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAg > 1:466888/1‑251 (MQ=255) gcgcAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTAt > 1:70784/1‑251 (MQ=255) cAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATcc < 1:610557/250‑1 (MQ=255) aaTTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAAccc < 1:720596/232‑1 (MQ=255) gTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACttt < 1:538789/238‑1 (MQ=255) gTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGa > 1:397366/1‑251 (MQ=255) cGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAAcc < 1:886653/251‑1 (MQ=255) aTGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCaaa > 1:463963/1‑251 (MQ=255) acacAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTg > 1:188303/1‑250 (MQ=255) cacaAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCg > 1:345946/1‑251 (MQ=255) cGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGTATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGt < 1:264110/251‑1 (MQ=255) gctttgGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACCTTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCggg > 1:434232/1‑251 (MQ=255) tttgGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGtt < 1:611783/251‑1 (MQ=255) ggTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAg > 1:701688/1‑250 (MQ=255) tCAGTTTCCAAGCTCCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGcc < 1:901806/250‑1 (MQ=255) tCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGcc < 1:389970/250‑1 (MQ=255) tCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCg > 1:622489/1‑251 (MQ=255) cgTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGAt > 1:170240/2‑251 (MQ=255) gTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCt < 1:30242/155‑1 (MQ=255) gTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCgg > 1:377387/1‑211 (MQ=255) gTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATg > 1:654692/1‑251 (MQ=255) tCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCg > 1:193893/1‑251 (MQ=255) ccTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATtaataa > 1:20452/1‑155 (MQ=255) cgcgcTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTtgtg < 1:272409/251‑1 (MQ=255) cgcgcTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTtgtg < 1:666593/251‑1 (MQ=255) tttGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTg < 1:832897/251‑1 (MQ=255) ttGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGcc < 1:86722/222‑1 (MQ=255) gCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATtaataa > 1:518461/1‑139 (MQ=255) cATATCCCCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:598606/251‑1 (MQ=255) cATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:391302/251‑1 (MQ=255) cATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:467919/251‑1 (MQ=255) cATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:787115/251‑1 (MQ=255) tatCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTa > 1:129766/1‑120 (MQ=255) tatCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCG‑TGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGt > 1:162711/1‑251 (MQ=255) tGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATtaat < 1:540357/125‑1 (MQ=255) gATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGt > 1:744313/1‑251 (MQ=255) attctCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCAttt > 1:594757/5‑108 (MQ=255) attctCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc > 1:183970/5‑238 (MQ=255) ttccttGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCTCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAATCAGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAACCGATGCCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCg > 1:869373/5‑225 (MQ=255) gTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTc > 1:143880/1‑206 (MQ=255) aGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATAc > 1:206499/1‑239 (MQ=255) gTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGga > 1:838173/1‑251 (MQ=255) aaTTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGAAAATc < 1:222464/250‑1 (MQ=255) cTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAGTACAATTTGAAACGTCATGgag < 1:776852/226‑1 (MQ=255) cTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGaacaagatcatgtaaagcagaacc < 1:299325/250‑23 (MQ=255) cGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTc > 1:872712/1‑110 (MQ=255) cGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGAAAATCAATAAGAAAAAACGGGTGGCATTATAACATa > 1:793117/1‑251 (MQ=255) | GTTTTGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTTTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCATGGAAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGAAAATCAATAAGAAAAAACGGGTGGCATTATAACATA > 1/1311753‑1312230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |