| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,311,985 | T→C | intergenic (+152405/+108952) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,311,985 | 0 | T | C | 100.0% | 146.2 / NA | 54 | intergenic (+152405/+108952) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (27/27); total (27/27) | |||||||||||
GTTTTGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTTTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCATGGAAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGAAAATCAATAAGAAAAAACGGGTGGCATTATAACATA > 1/1311753‑1312230 | gTTTTGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTa < 1:80352/250‑1 (MQ=255) 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ttGCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGcc < 1:86722/222‑1 (MQ=255) gCATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATtaataa > 1:518461/1‑139 (MQ=255) cATATCCCCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:598606/251‑1 (MQ=255) cATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:391302/251‑1 (MQ=255) cATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:467919/251‑1 (MQ=255) cATATCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATAc < 1:787115/251‑1 (MQ=255) tatCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTa > 1:129766/1‑120 (MQ=255) tatCACCGCTGATTCTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCACGGCAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCG‑TGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGt > 1:162711/1‑251 (MQ=255) 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GTTTTGTCGGTTTTCGGTTGCAGAATAAATAAGCGCAAATTTGGTGCGAGACTATGGGACACAAAATCTGTCACGGCAGGATTTTCTTTGCTTTGGGTCAGTTTCCAAGCACCTCGGCGCGCTTTTTGCATATCACCGCTGATTTTCCCCTGCTTTTTCTTTGGTTTGTGAGCTGCCAGTGCGAGGTAAGTTTTCTGAATTTGATGATATGCAAACTTTTGTGACAACGTCATGGAAGCCTGTTCATTTAATGCTAACATTAATAACCCCGAGGTCACTTTATCCAGCCGATGAACCAGCCAAACCTGCGGCACGCCAAGCTGTTGCGCCACCAGTCGGGTTAAGCCGATGTCGGCATCGTCTTTGTGTACGCTGATACCGTTCGGTTTGTTAATCACGATAAAATCAGGATGTTGAAATACAATTTGAAACGTCATGGAGAAAATCAATAAGAAAAAACGGGTGGCATTATAACATA > 1/1311753‑1312230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |