| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,308,115 | C→T | intergenic (+148535/+112822) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,308,115 | 0 | C | T | 100.0% | 34.9 / NA | 15 | intergenic (+148535/+112822) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (5/10); total (5/10) | |||||||||||
TGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTCTTAACGTATTGATTTAAACAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTGGTTTTAAACTTAGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAG > 1/1307894‑1308333 | tGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTAc < 1:543137/251‑1 (MQ=255) ataAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACtttagg < 1:279325/251‑4 (MQ=255) aaGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtt < 1:486843‑M1/251‑4 (MQ=255) cTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaacta > 1:117822‑M1/1‑241 (MQ=255) tttGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaagggg < 1:101781‑M1/251‑28 (MQ=255) ttttttAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagac < 1:299749‑M1/251‑34 (MQ=255) gTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTAttgttg < 1:553724/189‑1 (MQ=255) cAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagactaaagatttacacccaagtttaacctaatctttaaattattcaaa < 1:364573‑M1/251‑79 (MQ=255) ctctCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagactaaagatttacacccaagtttaacctaatctttaaattattcaaatgcaaaagcgaggaactatga > 1:258807‑M1/1‑149 (MQ=255) gTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagactaaagatttacacccaagtttaacctaatctttaaattattcaaatgcaaaagcgaggaactatgaaaaaaaaggattggagtagaaagcggat > 1:142910‑M1/1‑124 (MQ=255) aaaCTAAGTTTAATTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagac < 1:900553‑M1/139‑34 (MQ=255) aTTTACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagactaaagatttacacccaagtttaacctaatctttaaattattcaaatgcaaaagcgaggaactatgaaaaaaaaggattggagtagaaagcggattgtttacgagttacatgagcgaaacattac < 1:741275‑M1/251‑158 (MQ=255) tttACAATACCTATTAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagac < 1:174772‑M1/126‑34 (MQ=255) cctattAACGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTAttgttg > 1:136129/5‑77 (MQ=255) cGTATTGATTTAAATAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTAGgtttaaactaagtttaacgctaaggggtaagactaaagatttacacccaagtttaacctaatctttaaattattcaaatgcaaaagcgaggaactatgaaaaaaaaggattggagtagaaagcggattgtttacgagttacatg > 1:17737‑M1/1‑76 (MQ=255) | TGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAACTAAGTTTAATTTACAATACCTCTTAACGTATTGATTTAAACAAAAATAAATTTCTTTACATAAGTTTTACAAAATTTTTATTTAAACTATTGTTGACTTTGGTTTTAAACTTAGTTTAAACTAAGTTTAACGCTAAGGGGTAAGACTAAAGATTTACACCCAAGTTTAACCTAATCTTTAAATTATTCAAATGCAAAAGCGAGGAACTATGAAAAAAAAGGATTGGAGTAGAAAGCGGATTGTTTACGAGTTACATGAG > 1/1307894‑1308333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |