| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,307,829 | G→A | intergenic (+148249/+113108) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,307,829 | 0 | G | A | 100.0% | 148.9 / NA | 54 | intergenic (+148249/+113108) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (16/38); total (16/38) | |||||||||||
ATTGACTGCTTGTCCATAACTCTCCTTAGTTTATGCAACCAATTTAACTAAATTAATAATCTTCTCGTTAGCGCTTTCTTCGCTTAGTAATTCATAAATCATCCATACCATTTGCGCCTTGGCTTCGGGCTCCATGGTTTTGCGTGTCATTGCTAAGATTTCTTCAAGTGTGCTGATCGCCGTTAAAAAGCGCGCCTTGCTTACTTCCGTTAAGTCTTCTTTTGATGCGTTATATTGTGCGGTAGGCTCTTCTATTATATTGCGTTTAAAGCCTAGGGCGCGCTGCACCTCGTAAGGCATGGATAAATAATGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAAC > 1/1307584‑1308074 | aTTGACTGCTTGTCCATAACTCTCCTTAGTTTATGCAACCAATTTAACTAAATTAATAATCTTCTCGTTAGCGCTTTCTTCGCTTAGTAATTCATAAATCATCCATACCATTTGCGCCTTGGCTTCGGGCTCCATGGTTTTGCGTGTCATTGCTAAGATTTCTTCAAGTGTGCTGATCGCCGTTAAAAAGCGCGCCTTGCTTACTTCCGTTAAGTCTTCTTTTGATGCGTTATATTGTGCGGTAGACtctt > 1:185669/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTTTGCGTGTCATTGCTAAGATTTCTTCAAGTGTGCTGATCGCCGTTAAAAAGCGCGCCTTGCTTACTTCCGTTAAGTCTTCTTTTGATGCGTTATATTGTGCGGTAGACTCTTCTATTATATTGCGTTTAAAGCCTAGGGCGCGCTGCACCTCGTAAGGCATGGATAAATAATGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAAtt < 1:692607/235‑1 (MQ=255) tCATTGCTAAGATTTCTTCAAGTGTGCTGATCGCCGTTAAAAAGCGCGCCTTGCTTACTTCCGTTAAGTCTTCTTTTGATGCGTTATATTGTGCGGTAGACTCTTCTATTATATTGCGTTTAAAGCCTAGGGCGCGCTGCACCTCGTAAGGCATGGATAAATAATGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAAc < 1:338539/250‑1 (MQ=255) tCATTGCTAAGATTTCTTCAAGTGTGCTGATCGCCGTTAAAAAGCGCGCCTTGCTTACTTCCGTTAAGTCTTCTTTTAATGCGTTATATTGTGCGGTAGACTCTTCTATTATATTGCGTTTAAAGCCTAGGGCGCGCTGCACCTCGTAAGGCATGGATAAATAATGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAAc < 1:147169/250‑1 (MQ=255) 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gTAGACTCTTCTATTATATTGCGTTTAAAGCCTAGGGCGCGCTGCACCTCGTAAGGCATGGATAAATAATGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAAc < 1:522773/250‑1 (MQ=255) | ATTGACTGCTTGTCCATAACTCTCCTTAGTTTATGCAACCAATTTAACTAAATTAATAATCTTCTCGTTAGCGCTTTCTTCGCTTAGTAATTCATAAATCATCCATACCATTTGCGCCTTGGCTTCGGGCTCCATGGTTTTGCGTGTCATTGCTAAGATTTCTTCAAGTGTGCTGATCGCCGTTAAAAAGCGCGCCTTGCTTACTTCCGTTAAGTCTTCTTTTGATGCGTTATATTGTGCGGTAGGCTCTTCTATTATATTGCGTTTAAAGCCTAGGGCGCGCTGCACCTCGTAAGGCATGGATAAATAATGGTATTCGTATGTTTTCCCTTTTCTTCCTTTTATAAGTCGTCTTTCCCAGTTTTCTAATTTGGCTTTTTTAGTTACCCCTTGAACAGTTTCTGGTAGTCCAGCTACTCCCAAAAGGTCTTTCAGTTCTAGCCACTCTCGGATCATATCTAACCTCCTAGTTTTAAACCAAGGATTAAAAC > 1/1307584‑1308074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |