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tGGTTTTACCTTGCCCGCCGCTGTCAGAAAAAGAAAATTGTT‑GTTTGTACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAAt < 1:32163/251‑1 (MQ=255) ggTTTTACCTTGCCCGCCGCTGTCAGAAAAAGAAAATTGTT‑GTTTGTACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAg > 1:676798/1‑218 (MQ=255) ggTTTTACCTTGCCCGCCGCTGTCAGAAAAAGAAAATTGTT‑GTTTGTACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAAt > 1:834866/1‑242 (MQ=255) 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gtt‑gttTGTACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAGGATCACAGaa > 1:507180/1‑251 (MQ=255) t‑gtttgtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGAt < 1:774728/96‑1 (MQ=255) t‑gtttgtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAGGATCACAGaaaa > 1:870670/1‑251 (MQ=255) gtttgtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAg > 1:867939/1‑177 (MQ=255) tttgtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTg > 1:850372/1‑164 (MQ=255) tttgtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAAt < 1:334863/208‑1 (MQ=255) tttgtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCAAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAGGATCACAGaaaaaa > 1:663630/1‑251 (MQ=255) gtACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGc > 1:602603/1‑79 (MQ=255) caGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAgg < 1:9914/230‑1 (MQ=255) gCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAatga < 1:218078/101‑1 (MQ=255) gCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAGGATCACAGAAAAAAGTAAATTGtt > 1:805738/1‑251 (MQ=255) tACCTAGCCGGATTAAGCTGTTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAGGATCACAGAAAAAAGTAAATTGTTTTCCAg > 1:869389/1‑248 (MQ=255) 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CGTAACAAATGCCGGCGCCGGATTCAAATACTGAGTGAGAGTCTTTATTTTCTTTAATCTCAAACACTTCAAAGGCGATGCTTTTACCCAATTCACTCACATCAGCAGCATTTTTAGGATCGAATTTCTTGCCGTTATTTTGATTAATGTAAGTGGTTTTACCTTGCCCGCCGCTGTCAGAAAAAGAAAATTGTT‑GTTTGTACACAGCTCCGGCATACCTAGCCGGATTAAGCTATTGAGCGGTTTTATCGGTTATCACGCCATCTTCGGAAATATGCATAGTCCAAGATTCTGCAAAAGCCAATGATGAAAGGAAAGTAAAACTCAGACCGAGCGTTAATTTTTTGAAAAGCATCATTGGGACCCCTTAAGAATAAAGTGAAATGGAGTATAAATTATAAAATTGTACAAATCTCAAGCGGTAAGTTATCAGGATCACAGAAAAAAGTAAATTGTTTTCCAGTC > 1/19146‑19610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |