| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,284,824 | T→C | intergenic (+125244/+136113) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,284,824 | 0 | T | C | 100.0% | 174.7 / NA | 65 | intergenic (+125244/+136113) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/37); total (28/37) | |||||||||||
CACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTTGATCGTTCTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGTGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTAATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGGTGAAACTGGAGCGATA > 1/1284599‑1285064 | tcgatcatttcaccgtcaaaacgttcgttattataaatggcaattgccaataaaaacgccagacgatcggtgggtaaattcagcgaaaattcgcgttctttcgcccatgaaaccagttcggggattgtttgtgatgtttcaagcattaagggatctcacaatgcattatttaaacaaaaaattgcctagattatacaggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAAc < 1:641285‑M2/48‑1 (MQ=255) 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1:46221‑M2/150‑1 (MQ=255) gattgtttgtgatgtttcaagcattaagggatctcacaatgcattatttaaacaaaaaattgcctagattatacaggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGa > 1:579830‑M2/82‑151 (MQ=255) gattgtttgtgatgtttcaagcattaagggatctcacaatgcattatttaaacaaaaaattgcctagattatacaggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCAt < 1:88677‑M2/169‑1 (MQ=255) attgtttgtgatgtttcaagcattaagggatctcacaatgcattatttaaacaaaaaattgcctagattatacaggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATAc < 1:524373‑M2/171‑1 (MQ=255) gtttgtgatgtttcaagcattaagggatctcacaatgcattatttaaacaaaaaattgcctagattatacaggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATc 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1:223661‑M2/7‑54 (MQ=255) ggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTc > 1:866293‑M2/7‑143 (MQ=255) ggatttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTAttttt > 1:164557‑M2/7‑251 (MQ=255) atttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAAc > 1:368494‑M2/5‑227 (MQ=255) atttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTgg > 1:269542‑M2/5‑251 (MQ=255) atttAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTgg > 1:593525‑M2/5‑251 (MQ=255) tGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGGTGAAACTGGAg < 1:653629/251‑1 (MQ=255) aTAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGGTGAAACTGGAGCGata > 1:452668/1‑251 (MQ=255) tAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAatttattt < 1:889852/230‑1 (MQ=255) aGCAAGGGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCAc < 1:130105/186‑1 (MQ=255) | CACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTTGATCGTTCTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGTGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTAATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGGTGAAACTGGAGCGATA > 1/1284599‑1285064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |