| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,266,757 | A→G | intergenic (+107177/+154180) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,266,757 | 0 | A | G | 100.0% | 145.5 / NA | 54 | intergenic (+107177/+154180) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/22); total (32/22) | |||||||||||
GGTATAATAGGGTAGAACATTATTGAATAAATAACAAGGCAGGCAGTTTAAAAAGGTGATCCGATGCAATATTTTATATTACACCGGAAGAATGAACGGACTAAATAATCAGTTGAATTTTGTTTTTGTTGGTACCGGATAGTTCGATTAATTCCGCCATATTATTAATCGTAATGTATTTTCCTTGAACCGATAATACACCAAGTTTTTGGAAGCGACCGAGTAAACGACTGATAGTTTCAACGGTTAAACCGAGATAATTGCCGATATCACCACGAGTCATGGTTAAGCGGAATTCCCTGGCAGAAAAACCTCGGGCGGAGTAGCGTTGAGATAAGTTATAAATAAATGCGGCAAGACGTTCTTCTGCATTCATTTTAGAGAGTAATAAAATCATTTCCTGATCACTTTTAATTTCATTACTCATTAAACGCATAATTTGCTGGCGCAGTTTAGGCATTTTGCCGGATAAATCA > 1/1266516‑1266991 | ggTATAATAGGGTAGAACATTATTGAATAAATAACAAGGCAGGCAGTTTAAAAAGGTGATCCGATGCAATATTTTATATTACACCGGAAGAATGAACGGACTAAATAATCAGTTGAATTTTGTTTTTGTTGGTACCGGATAGTTCGATTAATTCCGCCATATTATTAATCGTAATGTATTTTCCTTGAACCGATAATACACCAAGTTTTTGGAAGCGACCGAGTAAACGACTGATAGTTTCGACGGTTaaa > 1:119750/1‑251 (MQ=255)ggTATAATAGGGTAGAACATTATTGAATAAATAACAAGGCAGGCAGTTTAAAAAGGTGATCCGATGCAATATTTTATATTACACCGGAAGAATGAACGGACTAAATAATCAGTTGAATTTTGTTTTTGTTGGTACCGGATAGTTCGATTAATTCCGCCATATTATTAATCGTAATGTATTTTCCTTGAACCGATAATACACCAAGTTTTTGGAAGCGACCGAGTAAACGACTGATAGTTTCGACGGTTaaa > 1:219278/1‑251 (MQ=255) taataGGGTAGAACATTATTGAATAAATAACAAGGCAGGCAGTTTAAAAAGGTGATCCGATGCAATATTTTATATTACACCGGAAGAATGAACGGACTAAATAATCAGTTGAATTTTGTTTTTGTTGGTACCGGATAGTTCGATTAATTCCGCCATATTATTAATCGTAATGTATTTTCCTTGAACCGATAATACACCAAGTTTTTGGAAGCGACCGAGTAAACGACTGATAGTTTCGACg < 1:633811/241‑1 (MQ=255) taataGGGTAGAACATTATTGAATAAATAACAAGGCAGGCAGTTTAAAAAGGTGATCCGATGCAATATTTTATATTACACCGGAAGAATGAACGGACTAAATAATCAGTTGAATTTTGTTTTTGTTGGTACCGGATAGTTCGATTAATTCCGCCATATTATTAATCGTAATGTATTTTCCTTGAACCGATAATACACCAAGTTTTTGGAAGCGACCGAGTAAACGACTGATAGTTTCGACGGTTAAACCga > 1:847015/1‑251 (MQ=255) 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GGTATAATAGGGTAGAACATTATTGAATAAATAACAAGGCAGGCAGTTTAAAAAGGTGATCCGATGCAATATTTTATATTACACCGGAAGAATGAACGGACTAAATAATCAGTTGAATTTTGTTTTTGTTGGTACCGGATAGTTCGATTAATTCCGCCATATTATTAATCGTAATGTATTTTCCTTGAACCGATAATACACCAAGTTTTTGGAAGCGACCGAGTAAACGACTGATAGTTTCAACGGTTAAACCGAGATAATTGCCGATATCACCACGAGTCATGGTTAAGCGGAATTCCCTGGCAGAAAAACCTCGGGCGGAGTAGCGTTGAGATAAGTTATAAATAAATGCGGCAAGACGTTCTTCTGCATTCATTTTAGAGAGTAATAAAATCATTTCCTGATCACTTTTAATTTCATTACTCATTAAACGCATAATTTGCTGGCGCAGTTTAGGCATTTTGCCGGATAAATCA > 1/1266516‑1266991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |