| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,248,618 | T→C | intergenic (+89038/+172319) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,248,618 | 0 | T | C | 100.0% | 183.5 / NA | 65 | intergenic (+89038/+172319) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/27); total (38/27) | |||||||||||
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cGTTGTCTAAGGTTTTTTCGCCGTAGTTAAATAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATc < 1:672904/133‑1 (MQ=255) tGTCTAAGGTTTTTTCGCCGTAGTTAAATAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTACATCGGCAAGGACTTGCAGCAAGCCTTTGTCGTATTGAAGTAAGGCAGCTTTCAGGCGGGCGTCGGCGGCGTCAATGTTGGCTTGAATGCGTCCGTTAGTGAAAATCGGCAGGCTAATg > 1:347028/1‑251 (MQ=255) gTCTAAGGTTTTTTCGCCGTAGTTAAATAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGc > 1:558381/1‑82 (MQ=255) gTCTAAGGTTTTTTCGCCGTAGTTAAATAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTAc > 1:387904/1‑132 (MQ=255) gTCTAAGGTTTTTTCGCCGTAGTTAAATAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTACATCGGCAAGGACTTGCAGCAAGCCTTTGTCGTATTGAAGTAAGGCAGCTTTCAGGCGGGCGTCGGCGGCGTCAATGTTGGCTTGAATGCGTCCGTTAGTGAAAATCGGCAGGCTAATGt > 1:401574/1‑251 (MQ=255) gTTAAATAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTACATCGGCAAGGACTTGCAGCAAGCCTTTGTCGTATTGAAGTAAGGCAGCTTTCAGGCGGGCGTCGGCGGCGTCAATGTTGGCTTGAATGCGTCCGTTAGTGAAAATCGGCAGGCTAATGTCGAGGCTCAACAAATTGccc > 1:502796/1‑250 (MQ=255) aaaTAATTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTACATCGGCAAGGACTTGCAGCAAGCCTTTGTCGTATTGAAGTAAGGCAGCTTTCAGGCGGGCGTCGGCGGCGTCAATGTTGGCTTGAATGCGTCCGTTAGTGAAAATCGGCAGGCTAATGTCGAGGCTcaacaa > 1:462303/1‑240 (MQ=255) aataatTTCTCCGCATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTAc < 1:684048/107‑1 (MQ=255) | GGCGCAGTGAAAAACATCGGGAAAACCACCGCACTTTTACAAAACGCAAAAGTGCGGTCGATTTCGCAAACGTTTTTTTCATCGCTCGGACCAACCGCCACCTAGTGCTTTATACAAACTAATCAAATTCTTCGCCCCCGCTAAACGGCTTTGGATGAGTTGGTTTTGGTAATCCAGTGCGGTGAGGCGGGCGGTGAGGGCGTTGTCTAAGGTTTTTTCGCCGTAGTTAAATAATTTCTCCGTATTGCCTGCCTGCTTTTGCGCCTGTTGGCAGGCGGTTTGTAGCAATTGGGTTTGGCGATTTAATGCGGCTTGTGCCTGATAGCTGTTATCTACATCGGCAAGGGCTTGCAGCAAGCCTTTGTCGTATTGAAGTAAGGCAGCTTTCAGGCGGGCGTCGGCGGCGTCAATGTTGGCTTGAATGCGTCCGTTAGTGAAAATCGGCAGGCTAATGTCGAGGCTCAACAAATTGCCC > 1/1248376‑1248850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |