| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,235,760 | A→G | intergenic (+76180/+185177) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,235,760 | 0 | A | G | 100.0% | 212.5 / NA | 74 | intergenic (+76180/+185177) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (44/30); total (44/30) | |||||||||||
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gATAAACGATCCTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAAACAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGTGATTTGGTGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGt > 1:185536/1‑250 (MQ=255) aTCCTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGaaa > 1:850417/1‑192 (MQ=255) aTCCTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGa < 1:124525/190‑1 (MQ=255) aTCCTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGTGAtt < 1:269341/216‑1 (MQ=255) aTCCTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGTGATTTGGGGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGTCCTCATgg > 1:700811/1‑250 (MQ=255) aTCCTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGGGATTTGGTGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGTCCTCATgg > 1:121303/1‑250 (MQ=255) cTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATg < 1:312859/43‑1 (MQ=255) cTATTATGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGTGATTTGGTGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGTCCTCATg < 1:521031/246‑1 (MQ=255) attatGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAACCCGGTGATTTGGTGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGTCCTCATGGCtct > 1:212767/1‑248 (MQ=255) attatGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGGGAtt > 1:646895/1‑211 (MQ=255) attatGGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGGGATTTGGTGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGGCCTCATg > 1:635625/1‑244 (MQ=255) | TCGTGTGGTGGTGTTCAAACCGGGACAAAAATTGCGCAACCGGGTTGAAAAGGTCAAACCGAAAGCTTAATAAATTGGCTACCGCAAGCGATTGTCGGTAGCTTTTTGTTATGGATGATTTATGCGTATTTCTTTTAAATCTCTACTTATTTGTTGTTCTGTCCTGGCGTTAGCCGCCTGTTCCGGAGGACCGTCAAAATCCTCGCGGATTAATTACAAAGGGCAGATAAACGATCCTATTATAGCGATTGCGCTTTTAAGCGAACAGCAATACGAATGGGCGGGAACGCCTTATCGTATCGGCGGACAAAGTCGCAGTGGCGTGGATTGCTCCGGTTTCGTGCAAACCACCTTTTTCGATCGCTTCGGCATAAAATTGCCGCGACAAACCAAAGATCAGGCAAATTACGGTCAGTATATTGAAAAAGGCGATATTCAAA‑CCGGTGATTTGGTGTTCTTTAAAACCGGTCGCGGTCCTCATGGCTAT > 1/1235517‑1236003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |