| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,231,439 | G→T | intergenic (+71859/+189498) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,231,439 | 0 | G | T | 98.7% | 195.9 / NA | 76 | intergenic (+71859/+189498) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (34/41); total (34/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
CTCGTAATCAGGGCAGTGAAAGTTCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCG‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATAGAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCACTAAAATTTCCTGCAGGACAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACAACGTTTTTTGAACG > 1/1231201‑1231685 | ctcGTAATCAGGGCAGTGAAAGTTCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCAtt > 1:828558/1‑251 (MQ=255)ctcGTAATCAGGGCAGTGAAAGTTCAAGCAATTCCGGCATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCAtt > 1:734580/1‑251 (MQ=255) aaTCAGGGCAGTGAAAGTTCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACgg > 1:581387/1‑251 (MQ=255) gCAGTGAAAGTTCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑g < 1:447900/250‑1 (MQ=255) aaGTTCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCg > 1:614427/1‑251 (MQ=255) ttCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCgg < 1:753142/249‑1 (MQ=255) cAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑Gaaa < 1:2187/250‑1 (MQ=255) cAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:64372/251‑1 (MQ=255) cAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:377989/251‑1 (MQ=255) cAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:456660/251‑1 (MQ=255) cAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:667271/251‑1 (MQ=255) cAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:229646/251‑1 (MQ=255) gTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:156456/243‑1 (MQ=255) gTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACtt > 1:603707/1‑251 (MQ=255) tatttattTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACttt < 1:503005/251‑1 (MQ=255) atttatttCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑gtgg > 1:206009/1‑227 (MQ=255) atttatttCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACtttt > 1:529829/1‑251 (MQ=255) atttatttCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACtttt > 1:351525/1‑251 (MQ=255) atttCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGc < 1:202320/251‑1 (MQ=255) atttCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGc < 1:756212/251‑1 (MQ=255) ttCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACttt > 1:772265/1‑244 (MQ=255) gtgtCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGGGGCGGTTT‑GAAAGGGTTACTTTT‑AAGc > 1:799997/1‑243 (MQ=255) gTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGTCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGc > 1:404420/1‑234 (MQ=255) gTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGaaaa > 1:804585/1‑251 (MQ=255) gCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGTGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGaaaaa > 1:512421/1‑250 (MQ=255) gCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGaaaaa > 1:597924/1‑250 (MQ=255) gCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCACCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCCTTGGaa > 1:433592/1‑247 (MQ=255) gtttgcGGTTTCTGGGAAAGCATGATCGCCTTGGGGTTCTCCCGTAAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGTTGGGGGGGATTTGGTGGGAAAAAAAAAAATGATTGATGCGTAAAAA‑CGTCTGAAAAGTTT‑GCATGACCCGAAAGAATTAGAGGGCCCCGCTTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGAAAAG‑GGGGGGGGGGTTT‑AAAAGAGTTATTTTA‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAg < 1:36021/245‑1 (MQ=255) gtgtTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCTGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACgg < 1:672213/185‑1 (MQ=255) gtgtTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTAAGAGCGGATGCCGGTTCGGGGGTTTTGGGGGGCAAAAAAAAAATGATTGATGCTTAAAAA‑CGTCTGAAAAGTTT‑GCATGACCCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCTTTTGCCATAAACGGTAAAC‑GTGGGGGGGTTTT‑AAAAGATTTATTTTT‑AACCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAg < 1:646578/250‑1 (MQ=255) tttCGTTTTCTGGGAAAGCATGATCGCCATGTGGTTCCCCCGTAACCGTGAATTCAGAGGGGATGCCGGTCGGGCGGTTTTGGTGGGAAAAAAAAAAATGATTGATGCTTAAAAA‑CGTCTGAAAAGTTG‑GAATGACCCGAAAAAATTAGAGGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAAGGGAAAAC‑GGGGGGGGGGTTT‑AAAAGATTTATTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGt < 1:360864/250‑1 (MQ=255) tttGGCAAGCATGCTCGCCTTGTGTTTCTCCCGTCAACGTAAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGTTTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCTTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGACCCGCAAAAATTAGAAGGCCCCGCTTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGTTTT‑GAAAGATTTCCTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGt < 1:251760/250‑1 (MQ=255) cAAGCAGGATCGCCAGGTGGTTCTCCCGTCAACGTAAATTAAGGGCGGATGCCGGTTCGGCGGTTTGGGTGGGAAAAAAAAAAATGATTGATGCGTAAAAA‑CGTCTGAAAAGTTT‑GCAGGAACCGAAAGAATTAGAAGGCCCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCAATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTATTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCg < 1:647791/250‑1 (MQ=255) aagcatgttcccgttgtgGTTCCCCCGTCAACGTGAATTAAGAGCGGAGGCGGGTTGGGCGGTTTGGGTGGGAAAAAAAAAAATGATTGATGC‑TTAAAACCTTCTGAAAAGTTT‑GCAGGAACCGAAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGTTAAAG‑GTGGTGGGGTTTT‑GAAAGAGTTATTTTT‑AACCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTc < 1:397250/237‑1 (MQ=255) aaGCATGATCGCCTTGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGGGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGGGGGCAAAAAAAAAATGATTGATGC‑TTAAAACCGTCTGAAAAGTTT‑GCATGAACCGAAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGGGGTTT‑GAAAGAGTTTTTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTc < 1:710676/251‑1 (MQ=255) tCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAg > 1:756840/1‑236 (MQ=255) gCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATaaaa > 1:404322/1‑251 (MQ=255) ccATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATaaaa > 1:20583/1‑250 (MQ=255) gtgGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCa > 1:468731/1‑251 (MQ=255) tgtttcccccGTCAACGTAAATTAAGAGGGGATGCCGGTTCGGGGGTTTTGGGGGGAAAAAAAAAAATGATTGATGCGTAAAAA‑CGTCGGAAAAGTTT‑GCATGAACCGAAAGAATTAGAAGGCTCCGCTTTAGCT‑GCATTTGCCATTAGCGGTAAAC‑GGGGTGGGGGTTT‑AAAAGAGTTATTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCAt < 1:259397/244‑1 (MQ=255) tgGTTCCCCCGTAAACGTGATTTCAGAGCGGATGCCGGTTGGGCGGTTTTGGTGGAAAAAAAAAAAATGATTGATGC‑TTAAAACCGTCTGAAAATTTG‑GAATAACCCGAAAGATTTGGAGGGC‑CCCCTTTTGGGTGCTTTGGCCTTTAGCGGAAACC‑GTGGTGG‑GGTTTAAAAAGAGTTATTTTA‑AAGCCCACCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCAt < 1:179500/251‑1 (MQ=255) tttcccccGTCAACGTGAATTCAGGGGGGATGCGGTTTGGGCGGTTTTGGTGGGCAAAAAAAAAATGATTGATGCGTAAAAA‑CGTCTGAAAATTTT‑GCATGAACCGCAAAAATTAGAGGGCCCCGCCTTAGCT‑GCTTTTCCCATTACCGGTAAAG‑GTGGTGGGGTTTT‑GAAAGATTTCTTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAg < 1:578511/221‑1 (MQ=255) cccGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCg > 1:410533/1‑251 (MQ=255) aCGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGa > 1:384094/1‑251 (MQ=255) cGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGcc < 1:294490/175‑1 (MQ=255) cGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGaa > 1:433528/1‑251 (MQ=255) tGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGTTTTGGTGGGCAAAAAAAAAATGATTGATGCGTAAAAA‑CGTCTGAAAAGTTT‑GCATGACCCGCAAAAATTAGAAGGCTCCGCTTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAACC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTTCTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAAt < 1:349520/250‑1 (MQ=255) gAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATat > 1:740379/1‑250 (MQ=255) aTTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATatag > 1:668923/1‑248 (MQ=255) ttCAGAGCGGATGCCGTGTCGGCGGGTGTGGTGGGCAAACAAAAAATGATAGATGCGTAAAAG‑CGTCGGCAAGGTTT‑GCAGTAACCGCAGAAATGAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGG‑AAACGGTGGGGGGGGTTA‑AAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCGCCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAgg < 1:835098/251‑1 (MQ=255) ttCAGAGCGGATGCCGGTTGGGCGGTTTTGGGGGGAAAACAAAAAATGATTGATGCGTAAAAG‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATAAGCCGCAAGAATTAGAAGGCTCGGCCTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAAGGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGATTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAgg < 1:293182/251‑1 (MQ=255) ttCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAAAG‑GTGGTGGGGTTTT‑GAAAGAGTTTCTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAgg < 1:104386/251‑1 (MQ=255) ggCGGATGCCGGTGCGGGGGTTTTGGTGGGAAAAAAAAAAATGATTGATGTTTAAAAA‑CGTCTGCAAATTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCTTTAGCT‑GCATTGGCTATTAAGGGAAAAG‑GTGGTGGGGTTTT‑GAAAGAGTTACTTTA‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCt < 1:774766/247‑1 (MQ=255) gATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAg > 1:886565/1‑251 (MQ=255) atgcgggttggggggttttGGTGGGAAAAAAAAAAATGATTGAGGCGTAAAAC‑CGTCTG‑AAAGTTTGGCATGACCCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTGGGCT‑GTTTTTGCCATTAACGTTAAAT‑GTGGTGGCGGTTT‑AAAAGATTTATTTTT‑AAGCCCCCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAg < 1:190691/234‑1 (MQ=255) gggtttggggggaaaaaaaaaaaaTGATTGGTGCGTAAAAG‑CGTCTGAAAAGTTT‑GCAAGAACCGAAAAAATAAGAAGGCTCCGCTTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGGGGTTT‑GAAAGAGTTATTTTA‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTAtttttt < 1:124449/232‑1 (MQ=255) ttttgggggggaaaaaaaaaaaGGATTGATG‑TTTAAAACCGTCTGAAAAGTTT‑GCAGGAACCGAAAGAATTAGAGGGCCCTGCCTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAAGGGAAAAG‑GTGGGGGCGGTTT‑AAAAGAGTTTTTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTg < 1:427274/234‑1 (MQ=255) gATTTGGTGGGAAAAAAAAAAAGGATTGATGCTTAAAAA‑CGTCTGAAAATTTG‑GCATGAACCGAAAGAATAAGAGGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAAGGGTAAAC‑GTGGTGGCGTTTT‑AAAAGATTTATTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTg < 1:50212/250‑1 (MQ=255) acaaaAAATGATTGATGCGTAAAAC‑CTTCTGAAATGTTT‑GCAGGACCCGAAAGAATTAGAAGCCCCCGCTTTAGTT‑GCTTTTGCCATTAAGGGAAAGG‑GTGGGGGCGTTTA‑GAAAGATTTTTTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGc < 1:900967/251‑1 (MQ=255) aaaaaaaTGATTGATGCTTTAAAC‑CGTCTGAAAAGTTT‑GCATGACCCGAAAGAATTAGAAGCCTCCGCTTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGTTTT‑AAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAgg < 1:289421/211‑1 (MQ=255) ataattaatgatttAAAA‑CTTCTGCAAGTTTT‑GCATAAGCCGCAAGAATAAGAAGCCTCCACTTAAGCT‑GCATTTGCAATTAACGGAAAGC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAA‑AATTTCTTTTAAACCCCCCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAg < 1:273689/239‑1 (MQ=255) aTGATTGATGCGTAAAAC‑CGTCTGAAATGTTT‑GCATGACCCGAAAGAATAAGAGGCCTCCTCCTTAGCT‑TCTTTTGCCATTACGGGTAAAC‑GTGGGGGCGTTTT‑AAAAGATTTTTTTTT‑AACCCATCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAg < 1:169460/251‑1 (MQ=255) tgattgatGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGa > 1:576383/1‑251 (MQ=255) attgatGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAag < 1:321475/106‑1 (MQ=255) gTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAg > 1:862925/1‑240 (MQ=255) gTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCAc > 1:279186/1‑249 (MQ=255) aaaa‑CTTCTGCAAAGTTT‑GCATAACCCGCAAGAATTAGAGGGCTCCGCTTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAACC‑GTGGTGGCTTTTT‑GAAAGATTTGTTTTT‑AAGCCCCCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCACTaaaa < 1:236676/251‑1 (MQ=255) gcaggacccgaaaGAATTAGAGGGCCCCGCCTTGGCT‑GCTTTTGCCATAAACGGTAAGC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTTTTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGc < 1:356441/164‑1 (MQ=255) gAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAgg > 1:207230/1‑161 (MQ=255) aaTTAGAAGGCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTc > 1:461182/1‑209 (MQ=255) ggCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAg > 1:383250/1‑108 (MQ=255) gCTCCGCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCACTAAAATTTCCTGCAGGACAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACAACGtt > 1:277652/1‑251 (MQ=255) gCCTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAgg > 1:155885/1‑146 (MQ=255) ccTTAGCT‑GCTTTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTTTTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCACTAAAATTTCCTGCAGGACAAAAAg < 1:180394/223‑1 (MQ=255) ccTTAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAAc > 1:468143/1‑99 (MQ=255) tAGCT‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGGGGTTT‑GAAAGATTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATATAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCACTAAAATTTCCTGCAGGACAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACAACGTTTTTTGAACg < 1:38840/251‑1 (MQ=255) | CTCGTAATCAGGGCAGTGAAAGTTCAAGCAATTCCGGTATTTATTTCTTGGTGTCCATGGTGCTGGAAGTGGTGTTCGGTTTCTTGGCAAGCATGATCGCCATGTGGTTCTCCCGTCAACGTGAATTCAGAGCGGATGCCGGTTCGGCGGATTTGGTGGGCAAACAAAAAATGATTGATGCGTTAAAA‑CGTCTGCAAAGTTT‑GCATGAACCGCAAGAATTAGAAGGCTCCGCCTTAGCG‑GCATTTGCCATTAACGGTAAAC‑GTGGTGGCGGTTT‑GAAAGAGTTACTTTT‑AAGCCACCCGCCGTTGGAAAAACGTATTGAAGCGTTGCAACAGTTGCGTCAGTTATAAAATTTCATTTTACCGATACGGAATAGAGGCTTTTGAAGCCTCTATTTTTTTGTCTATGAAAAATAGCTTAATAGATTCAGCACTAAAATTTCCTGCAGGACAAAAAGTGCGGTCACAAAAAACAACGTTTTTTGAACG > 1/1231201‑1231685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |